1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
gtatagccttcaactgttattaaatgttattaacttatttggggtgtacatttactatatctttttgtgaataaactatcctggatttctctgtcataggagaaagttgatgattcttattctcttgaaaattgtagATCCCTTTCTGTGTGGTTGTTGGATGGTGCATGGGAAAAGAAATGGACTTAAATTTTCAACTATTTGAGACTGCCACACTTTTTATCACTGTGTTAGTAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA15G00380.2 |
intron # | 8 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCACTATTGGAGTTGCTATTGGATCATCTACACAGATATCTATGTTTGTG ATCCCTTTCTGTGTGGTTGTTGGATGGTGCATGGGAAAAGAAATGGACTTAEST: gi|208047251|gb|GD844348.1|GD844348
genomic: TCACTATTGGAGTTGCTATTGGATCATCTACACAGATATCTATGTTTGTGgtatagcctt ... aaaattgtagATCCCTTTCTGTGTGGTTGTTGGATGGTGCATGGGAAAAGAAATGGACTTA
EST: CTATGTCTGTG ATCCCTTTCTGTGTGGTTGTTGGATGGTGCATGGGAAAAGAAATGGACTTAEST: gi|21887557|gb|BQ740770.1|BQ740770
genomic: CTATGTTTGTGgtatagcctt ... aaaattgtagATCCCTTTCTGTGTGGTTGTTGGATGGTGCATGGGAAAAGAAATGGACTTA
EST: TCACTATTGGAGTTGCTATTGGATCATCTACACAGATATCTATGTTTGTG ATCCCTTTCTGTGTGTTTGTTGGATGGTGCATGGGAAAAGAAATGGACTTA
genomic: TCACTATTGGAGTTGCTATTGGATCATCTACACAGATATCTATGTTTGTGgtatagcctt ... aaaattgtagATCCCTTTCTGTGTGGTTGTTGGATGGTGCATGGGAAAAGAAATGGACTTA
ggatttctctgtcataggagaaagttgatgattcttattctcttgaaaattgtagATCCCTTTCTGTGTGGTTGTTGGATGGTGCATGGGAAAAGAAATGGACTTAAATTTTCAACTATTTGAGACTGCCACACTTTTTATCACTGTGTTAGTAG
agttgat putative branch site (score: 5)
attcttatt TA-rich tract