1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtatgcctaataaattccatgattatttgttttgttcttttaacatagattgatctgctgtattttgtgcactaagcgataattcatgggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCATGCAAAATCAGTCTGAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA11G08290.1 |
intron # | 8 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCEST: gi|58023403|gb|CX710144.1|CX710144
genomic: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
EST: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCEST: gi|193339713|gb|FK302316.1|FK302316
genomic: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
EST: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTACAAGGATTTGCTGGCGTCEST: gi|57574672|gb|CX547647.1|CX547647
genomic: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGT-CAAGGATTTGCTGGCGTC
EST: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCEST: gi|6847457|gb|AW349818.1|AW349818
genomic: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
EST: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCEST: gi|254318747|gb|GR830311.1|GR830311
genomic: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
EST: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGG-TTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGEST: gi|213602700|gb|DB978115.1|DB978115
genomic: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTG
EST: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCEST: gi|213597471|gb|DB981639.1|DB981639
genomic: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
EST: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCEST: gi|214006796|gb|DB987664.1|DB987664
genomic: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
EST: TCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGAGCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCEST: gi|254318748|gb|GR830312.1|GR830312
genomic: TCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
EST: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCEST: gi|21602391|gb|BQ612722.1|BQ612722
genomic: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
EST: GATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCEST: gi|151395379|gb|EV265250.1|EV265250
genomic: GATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
EST: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCEST: gi|13479589|gb|BG508932.1|BG508932
genomic: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
EST: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCEST: gi|208307682|gb|GE109278.1|GE109278
genomic: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
EST: TAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCTTCCEST: gi|208301073|gb|GE097338.1|GE097338
genomic: TAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
EST: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTNACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCEST: gi|22931412|gb|BU548551.1|BU548551
genomic: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
EST: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCEST: gi|6069956|gb|AW099536.1|AW099536
genomic: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
EST: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCEST: gi|27426751|gb|CA938271.1|CA938271
genomic: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
EST: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCEST: gi|209715415|gb|BW684699.1|BW684699
genomic: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
EST: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCEST: gi|37995492|gb|CF807081.1|CF807081
genomic: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
EST: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCEST: gi|193638789|gb|FK585990.1|FK585990
genomic: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
EST: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTNTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCEST: gi|193554701|gb|FK515538.1|FK515538
genomic: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
EST: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTNTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCEST: gi|193554701|gb|FK515538.1|FK515538
genomic: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
EST: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCG CTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTNTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
genomic: TGAGCAAATTGTTAGCTGATCAATCCTTTGTATCTTCTATCCTTGCATCGgtatgcctaa ... ggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCC
catagattgatctgctgtattttgtgcactaagcgataattcatgggttctgcagCTTCCTGGGGTTGACCCAAATGACCCTTCTGTCAAGGATTTGCTGGCGTCCATGCAAAATCAGTCTGAG
gattgat putative branch site (score: 4)
ataattcat TA-rich tract