Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

taacttgaaatctgctagtgtcctcattcctctgcatccactatttatgtttttttggtcaaataaattcattgttttgaggtgatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGAGGTTGCGTTGTTGACCATTGCACCTGATTATGCTTTCGGTACATCAGAG

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA18G32830.1
intron # 7
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA18G32830.1 (Glycine max), 3'ss of exon 7
lower sequence: AT3G25230.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 7
-taacttgaaatctgctagtgtcct--------cattcctctgcatcc-------------actatttatgtttt-tttggtcaaataaattcattgttttgaggtgatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGAGGTTGCGTTGTTGACCATTGCACCTGATTATGCTTTCGGTACATCAGAG
 |||||  | |  | ||||| |  |        | ||||| || ||               | | |  |||  ||  || ||||    || |||||   | || |   | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||| || || ||| ||||||| |  ||||| ||||| || ||| |    || 
gtaactacacagttcctagtatttttctgataactttcctttggatagttggatgtgctggattttccatggcttacttagtcatggtaactcatttactggatgct-taaacagAGCAAGTTGTCGATGGACTTGATAGAGCTGTCATGAAGATGAAAAAGGGTGAAGTGGCATTGGTGACCATAGACCCTGAGTATGCCTTTGGTTCTAATGA-

upper sequence: GLYMA18G32830.1 (Glycine max), 3'ss of exon 7
lower sequence: Vv00s0769g00010.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 7
-taacttgaaatctgctagtgtcctcattcctctgcatccactatttatgttt-ttttggtcaaataaattcattgttttgaggtgatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGAGGTTGCGTTGTTGACCATTGCACCTGATTATGCTTTCGGTACATCAGAG
 ||| |  ||  | | |  |   | |||         |    | | ||   || |||||  |      | | | | ||||    |  || ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |  | || |||    | |||||||| || ||  |||| || 
gtaattataatgcagtttttcaacccatggtaggtttttaggtttgtactcttattttgaccttgaggaatgaat-ttttccctttctggacagAGCAAGTTATCGATGGGCTTGATAGAGCTGTAATGACAATGAAGAAGGGTGAGGTAGCCCTTCTCACTATTCATTCAGATTATGCATTTGGCTCATCTGA-

upper sequence: GLYMA18G32830.1 (Glycine max), 3'ss of exon 7
lower sequence: Vv00s0958g00020.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
-taacttgaaatctgctagtgtcctcattcctctgcatccactatttatgttt-ttttggtcaaataaattcattgttttgaggtgatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGAGGTTGCGTTGTTGACCATTGCACCTGATTATGCTTTCGGTACATCAGAG
 ||| |  ||  | | |  |   | |||         |    | | ||   || || ||  |      | | | | ||||    |  || ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |  | || |||    | |||||||| || ||  |||| || 
gtaattataatgcagtttttcaacccatggtaggtttttaggtttgtactcttattctgaccttgaggaatgaat-ttttccctttctggacagAGCAAGTTATCGATGGGCTTGATAGAGCTGTAATGACAATGAAGAAGGGTGAGGTAGCCCTTCTCACTATTCATTCAGATTATGCATTTGGCTCATCTGA-

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|193333217|gb|FK298751.1|FK298751
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|193549508|gb|FK510549.1|FK510549
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|193668794|gb|FK609028.1|FK609028
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|298183231|gb|HO028216.1|HO028216
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|208034341|gb|GD833411.1|GD833411
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|192334305|gb|FK024404.1|FK024404
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|17400187|gb|BM176969.1|BM176969
EST:     AA-GGAGATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|193610133|gb|FK565697.1|FK565697
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|193555373|gb|FK511044.1|FK511044
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGG                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|13790585|gb|BG653176.1|BG653176
EST:     GAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAATA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: GAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|208258582|gb|GE055029.1|GE055029
EST:     TTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: TTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|207801684|gb|GD775168.1|GD775168
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|193467266|gb|FK434367.1|FK434367
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|151413161|gb|EV282969.1|EV282969
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|208270880|gb|GE066122.1|GE066122
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|193618551|gb|FK566683.1|FK566683
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|207834832|gb|GD808595.1|GD808595
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|193551876|gb|FK507289.1|FK507289
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|208315086|gb|GE113078.1|GE113078
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|151412679|gb|EV282491.1|EV282491
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|192316447|gb|FK008180.1|FK008180
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|193656286|gb|FK603346.1|FK603346
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGG                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|193631753|gb|FK582744.1|FK582744
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATAAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|208315913|gb|GE110615.1|GE110615
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|193323915|gb|FK290095.1|FK290095
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTG
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTG
EST: gi|208234692|gb|GE031495.1|GE031495
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|6724715|gb|AW309048.1|AW309048
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|193528361|gb|FK483919.1|FK483919
EST:     AATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|208073690|gb|GD872815.1|GD872815
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTC-AAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|193439231|gb|FK404440.1|FK404440
EST:     GGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: GGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|208160855|gb|GD965535.1|GD965535
EST:     ATTCAAAACAGTTGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: ATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|207739848|gb|GD717048.1|GD717048
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|208104577|gb|GD904554.1|GD904554
EST:     AATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|192316448|gb|FK008181.1|FK008181
EST:     AGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|193449677|gb|FK416516.1|FK416516
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|193650836|gb|FK600355.1|FK600355
EST:     CCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: CCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
EST: gi|208265572|gb|GE063100.1|GE063100
EST:     AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGA                         ACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA
genomic: AAGGGCCATGATGAAGAAGAGAAGCTGTTTGAATTCAAAACAGATGAGGGtaacttgaaa ... gatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGA


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

cactatttatgtttttttggtcaaataaattcattgttttgaggtgatgaacagaACAAGTTGTTGATGGACTTGATAGAGCTGTATTGACTATGAAGAAGGGTGAGGTTGCGTTGTTGACCATTGCACCTGATTATGCTTTCGGTACATCAGAG
                      aaataaattcattgtt  TA-rich tract