1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
...aaaaaccaacataactataccataatgatcatatgctaagaactgactgattaatctcagtagttatctgtatttagcttatgatctctttggttatcagAGTTGGTGAAGATTGGCCACTATATGATATCTTGAATCAATTCAAGAATGGTCAAAGCCACATGGCTGTTGTCCTCAAGTGTGGAGAGAACATCAGAACT
species | Glycine max |
transcript | GLYMA16G29610.1 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
actgattaatctcagtagttatctgtatttagcttatgatctctttggttatcagAGTTGGTGAAGATTGGCCACTATATGATATCTTGAATCAATTCAAGAATGGTCAAAGCCACATGGCTGTTGTCCTCAAGTGTGGAGAGAACATCAGAACT
tctcttt CT-rich tract
tgtattta TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| aaaaaccaacataactataccataatgatcatatgctaagaactgactgattaatctcagtagttatctgtatttagcttatgatctctttggttatcagAGTTGGTGAAGATTGGCCACTATATGATATCTTGAATCAATTCAAGAATGGTCAAAGCCACATGGCTGTTGTCCTCAAGTGTGGAGAGAACATCAGAACT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGTT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGA
- - -ccaacat
- - - - - - - - - - - - - - -catatgc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ctgactg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gcttatg