1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' |
gtaagcatctgatattgaataattgccatttatggtgacttatgttttccaaaagattgtggtctagagtctagacaatgcatttcttgtagtgatgaattaatgacaagtgttgagtactataagtttaacattttttttcatctgcagATATGTGGGCAATGGGTGCTATAATGGCTGAGTTGTTCACTCTCCGTCCTCTATTCCCCGGTTCCAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA16G08080.1 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCGTGCTCCTGAAGTCCTGCTTCAGTCCCATCTATATAGCTCTAAAGTTG ATATGTGGGCAATGGGTGCTATAATGGCTGAGTTGTTCACTCTCCGTCCTCEST: gi|208264634|gb|GE063954.1|GE063954
genomic: TCGTGCTCCTGAAGTCCTGCTTCAGTCCCATCTATATAGCTCTAAAGTTGgtaagcatct ... tcatctgcagATATGTGGGCAATGGGTGCTATAATGGCTGAGTTGTTCACTCTCCGTCCTC
EST: TCGTGCTCCTGAAGTCCTGCTTCAGTCCCATCTATATAGCTCTAAAGTTG ATATGTGGGCAATGGGTGCTATAATGGCTGAGTTGTTCACTCTCCGTCCTCEST: gi|208102908|gb|GD900898.1|GD900898
genomic: TCGTGCTCCTGAAGTCCTGCTTCAGTCCCATCTATATAGCTCTAAAGTTGgtaagcatct ... tcatctgcagATATGTGGGCAATGGGTGCTATAATGGCTGAGTTGTTCACTCTCCGTCCTC
EST: TCGTGCTCCTGAAGTCCTGCTTCAGTCCCATCTATATAGCTCTAAAGTTG ATATGTGGGCAATGGGTGCTATAATGGCTGAGTTGTTCACTCTCCGTCCTCEST: gi|10237923|gb|BE806811.1|BE806811
genomic: TCGTGCTCCTGAAGTCCTGCTTCAGTCCCATCTATATAGCTCTAAAGTTGgtaagcatct ... tcatctgcagATATGTGGGCAATGGGTGCTATAATGGCTGAGTTGTTCACTCTCCGTCCTC
EST: TCGTGCTCCTGAAGTCCTGCTTCAGTCCCATCTATATAGCTCTAAAGTTG ATATGTGGGCAATGGGTGCTATAATGGCTGAGTTGTTCACTCTCCGTCCTCEST: gi|207754685|gb|GD729308.1|GD729308
genomic: TCGTGCTCCTGAAGTCCTGCTTCAGTCCCATCTATATAGCTCTAAAGTTGgtaagcatct ... tcatctgcagATATGTGGGCAATGGGTGCTATAATGGCTGAGTTGTTCACTCTCCGTCCTC
EST: TCGTGCTCCTGAAGTCCTGCTTCAGTCCCATCTATATAGCTCTAAAGTTG ATATGTGGGCAATGGGTGCTATAATGGCTGAGTTGTTCACTCTCCGTCCTCEST: gi|10237927|gb|BE806815.1|BE806815
genomic: TCGTGCTCCTGAAGTCCTGCTTCAGTCCCATCTATATAGCTCTAAAGTTGgtaagcatct ... tcatctgcagATATGTGGGCAATGGGTGCTATAATGGCTGAGTTGTTCACTCTCCGTCCTC
EST: TCGTGCTCCTGAAGTCCTGCTTCAGTCCCATCTATATAGCTCTAAAGTTG ATATGTGGGCAATGGGTGCTATAATGGCTGAGTTGGTCACTCTGCGTCCTC
genomic: TCGTGCTCCTGAAGTCCTGCTTCAGTCCCATCTATATAGCTCTAAAGTTGgtaagcatct ... tcatctgcagATATGTGGGCAATGGGTGCTATAATGGCTGAGTTGTTCACTCTCCGTCCTC
tgaattaatgacaagtgttgagtactataagtttaacattttttttcatctgcagATATGTGGGCAATGGGTGCTATAATGGCTGAGTTGTTCACTCTCCGTCCTCTATTCCCCGGTTCCAG
gtttaac putative branch site (score: 3)
cattttttttcatct CT-rich tract
tactataagtttaaca TA-rich tract