1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
gtatttccatatttgtctccatttctttttcagtttgcttgttgattgaagttttcttgttcaattaaatgttagcgggtgtgtctatgcagACTGTTACTGCTGTAGAATGGCACCGGAAAGGTGACTACTTTTCGACAGTGATGCCAGCAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA16G00540.1 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTAAGGCACTTTAAG ACTGTTACTGCTGTAGAATGGCACCGGAAAGGTGACTACTTTTCGACAGTGEST: gi|151411237|gb|EV281048.1|EV281048
genomic: TTAAGGCACTTTAAGgtatttccat ... gtctatgcagACTGTTACTGCTGTAGAATGGCACCGGAAAGGTGACTACTTTTCGACAGTG
EST: GCTGGCTTAAAGATGATAAACATATGGGTTTAAGGTTAAGGCACTTTAAG ACTGTTACTGCTGTAGAATGGCACCGGAAAGGTGACTACTTTTCGACAGTGEST: gi|7686391|gb|AW757039.1|AW757039
genomic: GCTGGCTTAAAGATGATAAACATATGGGTTTAAGGTTAAGGCACTTTAAGgtatttccat ... gtctatgcagACTGTTACTGCTGTAGAATGGCACCGGAAAGGTGACTACTTTTCGACAGTG
EST: GCTGGCTTAAAGATGATAAACATATGGGTTTAAGGTTAAGGCACTTTAAG ACTGTTACTGCTGTAGAATGGCACCGGAAAGGTGACTACTTTTCGACAGTGEST: gi|18038858|gb|BM307152.1|BM307152
genomic: GCTGGCTTAAAGATGATAAACATATGGGTTTAAGGTTAAGGCACTTTAAGgtatttccat ... gtctatgcagACTGTTACTGCTGTAGAATGGCACCGGAAAGGTGACTACTTTTCGACAGTG
EST: GCTGGCTTAAAGATGATAAACATATGGGTTTAAGGTTAAGGCACTTTAAG ACTGTTACTGCTGTAGAATGGCACCGGAAAGGTGACTACTTTTCGACAGTG
genomic: GCTGGCTTAAAGATGATAAACATATGGGTTTAAGGTTAAGGCACTTTAAGgtatttccat ... gtctatgcagACTGTTACTGCTGTAGAATGGCACCGGAAAGGTGACTACTTTTCGACAGTG
cttgttgattgaagttttcttgttcaattaaatgttagcgggtgtgtctatgcagACTGTTACTGCTGTAGAATGGCACCGGAAAGGTGACTACTTTTCGACAGTGATGCCAGCAG
tgttgat putative branch site (score: 4)
ttcaattaaatgtta TA-rich tract