Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   		22  
 5'  3'   		23  
 5'  3'   		24  
 5'  3'   		25  
 5'  3'   		26  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtgagtatgagcaatatgcaaatggaatttctatatcttttgagtctttagttctgtttctatatgactcatcatgattctaatcttgttgacttttcccccccttttctttctcatttaatagAGGCTTGAGAGGGAACAATTTGGTTGGTTCACTATCACCAGACCTGTGCCAATTAACTGGGCTGTGGTATTT

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA14G11220.2
intron # 7
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|208292969|gb|GE096303.1|GE096303
EST:     AGAAATACCAAGGCTTATATATTGGAACGAAGTTTTGCAATATCT                         AGGCTTGAGAGGGAACAATTTGGTTGGTTCACTATCACCAGACATGTGCCA
genomic: AGAAATACCAAGGCTTATATATTGGAACGAAGTATTGCAGTATCTgtgagtatga ... catttaatagAGGCTTGAGAGGGAACAATTTGGTTGGTTCACTATCACCAGACCTGTGCCA






















 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

catcatgattctaatcttgttgacttttcccccccttttctttctcatttaatagAGGCTTGAGAGGGAACAATTTGGTTGGTTCACTATCACCAGACCTGTGCCAATTAACTGGGCTGTGGTATTT
        ttctaatcttgttgac  CT-rich tract
                                        tttctcatttaata  TA-rich tract