1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
...agtctgcccaaactgcactattgtggtatatccgtcactgagttcataaaatgcctttatattttaacttaatcctgaacgatttctggctgtactgtagCCTGATGTTACAGCTCCCGGATTAAACATCCTTGCAGCATGGTCTCCAGCCTCAGCTGGAATGAAGTTCAATATTATATCAGGAACTTCTATGTCTTGTC
species | Glycine max |
transcript | GLYMA11G09420.1 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
ataaaatgcctttatattttaacttaatcctgaacgatttctggctgtactgtagCCTGATGTTACAGCTCCCGGATTAAACATCCTTGCAGCATGGTCTCCAGCCTCAGCTGGAATGAAGTTCAATATTATATCAGGAACTTCTATGTCTTGTC
tttatattttaactta TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| agtctgcccaaactgcactattgtggtatatccgtcactgagttcataaaatgcctttatattttaacttaatcctgaacgatttctggctgtactgtagCCTGATGTTACAGCTCCCGGATTAAACATCCTTGCAGCATGGTCTCCAGCCTCAGCTGGAATGAAGTTCAATATTATATCAGGAACTTCTATGTCTTGTC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TCAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGGA
agtctgc
- - - -ccaaact
- - - - - - - - - - -tgtggta
- - - - - - - - - - - - - - - - - - -ctgagtt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tcctgaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ttctggc