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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...taaacttagtttgatatttatgtgtacacccaactacgtttactttccatttttactctatcttttttgaattctgacatttctgttttggtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAACGGGCCACAATTATATCAG

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA08G17810.5
intron # 7
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA08G17810.3 (Glycine max), 3'ss of exon 7
lower sequence: AT1G79210.3 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 7
-taaacttagtttgatat--ttatgtgtacacccaactacgtttactttccatttttactctatcttttttgaattctgacatttctgttttggtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAACGGGCCACAATTATATCAG
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attgatttggcgtgagataatgttgttaatgcaaatctgtatttgcaaactagact-actgaatcttgcttctaatct--ctgtctccttctgctgttaatagTGGTGTTAGGCCGTTTGGAGTTTCTCTACTGGTGGCTGGGTATGATGACAAGGGTCCACAACTGTATCAA
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|15000807|gb|BI321621.1|BI321621
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTG
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTG
EST: gi|27424967|gb|CA936487.1|CA936487
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|13311848|gb|BG405499.1|BG405499
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|4305924|gb|AI443831.1|AI443831
EST:     AACTTGTCAAGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATTCTGG                         TG-TGTTAGGCC
genomic: AACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAAT-CTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCC
EST: gi|13563115|gb|BG551335.1|BG551335
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|24135847|gb|BU926357.1|BU926357
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|151393662|gb|EV263537.1|EV263537
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|31459786|gb|CD401814.1|CD401814
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|31307072|gb|CD392275.1|CD392275
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|14990436|gb|BI316109.1|BI316109
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|27425474|gb|CA936994.1|CA936994
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|120534400|gb|EH262533.1|EH262533
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|7691886|gb|AW760004.1|AW760004
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|31460635|gb|CD402663.1|CD402663
EST:     TGCAGGAA-TTACTCAATCTGG                         TGGTGTTA-GCCTTTTGGAGTGT-CCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: TGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|207767049|gb|GD737011.1|GD737011
EST:     AACTTGTCNGGGAAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTG
genomic: AACTTGTCAGGGAA-GTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTG
EST: gi|208333367|gb|GE126132.1|GE126132
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|209701354|gb|BW655950.1|BW655950
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|37996790|gb|CF808379.1|CF808379
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGCGTTAGGCCTTTT
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTT
EST: gi|9259235|gb|BE347443.1|BE347443
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|120534404|gb|EH262537.1|EH262537
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|120533401|gb|EH261534.1|EH261534
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|57574332|gb|CX547307.1|CX547307
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTGGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|10253765|gb|BE821531.1|BE821531
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGNNNNTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|8283306|gb|BE020867.1|BE020867
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATGA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|151411669|gb|EV281480.1|EV281480
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|207710725|gb|GD691717.1|GD691717
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAACCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGTTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|12772095|gb|BG237022.1|BG237022
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|31468302|gb|CD410330.1|CD410330
EST:     TCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
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EST: gi|15815210|gb|BI787485.1|BI787485
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|23062603|gb|BU578520.1|BU578520
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|15285795|gb|BI469686.1|BI469686
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|209701353|gb|BW655949.1|BW655949
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|208330695|gb|GE132640.1|GE132640
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGACTAGCTGCTGGGTTTGATGATA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTG-CTAGTTGCTGGGTTTGATGATA
EST: gi|31463429|gb|CD405457.1|CD405457
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGC                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|31309819|gb|CD395022.1|CD395022
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|7690855|gb|AW758992.1|AW758992
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATNTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|26058444|gb|CA801358.1|CA801358
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|27446035|gb|CA953158.1|CA953158
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|15815476|gb|BI787751.1|BI787751
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|17023069|gb|BM094103.1|BM094103
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|58014939|gb|CX701681.1|CX701681
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCATTCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTCTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|26058340|gb|CA801254.1|CA801254
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|31310507|gb|CD395710.1|CD395710
EST:     CGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|6567102|gb|AW234729.1|AW234729
EST:     CAACTTGTCAAGGAAGTTGCCGCCGTAATGCANGAATNTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|298192268|gb|HO036350.1|HO036350
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
EST: gi|58015356|gb|CX702098.1|CX702098
EST:     CAACTTGTCAGGGAAGTNGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGG                         TGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA
genomic: CAACTTGTCAGGGAAGTTGCCGCCGTAATGCAGGAATTTACTCAATCTGGgtaaatattt ... gtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAA


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tccatttttactctatcttttttgaattctgacatttctgttttggtcctaatagTGGTGTTAGGCCTTTTGGAGTGTCCCTGCTAGTTGCTGGGTTTGATGATAACGGGCCACAATTATATCAG
                          ttctgac  putative branch site (score: 2)
             tatcttttttgaatt  TA-rich tract