1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
...gtactttcagaagctattttagatgcataatttatagcgataaacttgcagtgcacaaaatcgccatgtttcattaacttggatatttttatgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTGGGGAACTTCATTACCATTACTACCCAGTTACCCCAAGCACCGTGGAACA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA04G37030.3 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTGEST: gi|254323597|gb|GR840238.1|GR840238
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
EST: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTGEST: gi|254321270|gb|GR824587.1|GR824587
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
EST: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTG-TG-AGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGAEST: gi|58021915|gb|CX708656.1|CX708656
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGA
EST: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTGEST: gi|9204011|gb|BE330235.1|BE330235
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
EST: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTGGEST: gi|8827022|gb|BE210752.1|BE210752
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
EST: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTGEST: gi|6667609|gb|AW279060.1|AW279060
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
EST: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTGEST: gi|254338527|gb|GR849945.1|GR849945
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
EST: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTGEST: gi|38193229|gb|CF922435.1|CF922435
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
EST: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTGEST: gi|6724850|gb|AW309249.1|AW309249
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
EST: ATTTATCA-CCATACATTTCGTGATGGGGCCAGTGCTGCAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGCGACCAAATGGATGGAAGAACCTGTCTGGTGATGATGTTGEST: gi|254338528|gb|GR849946.1|GR849946
genomic: ATTTATCATGCA-ACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
EST: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTGEST: gi|214009174|gb|DB989890.1|DB989890
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
EST: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTGEST: gi|254321271|gb|GR824588.1|GR824588
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
EST: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTGEST: gi|27425975|gb|CA937495.1|CA937495
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
EST: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTGEST: gi|254322198|gb|GR837612.1|GR837612
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
EST: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTGEST: gi|254322199|gb|GR837613.1|GR837613
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
EST: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTGEST: gi|192319717|gb|FK013759.1|FK013759
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
EST: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTGEST: gi|10255040|gb|BE822806.1|BE822806
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
EST: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTGEST: gi|192319718|gb|FK013760.1|FK013760
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
EST: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTGEST: gi|17998750|gb|BI119560.1|BI119560
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
EST: AATCTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTGEST: gi|192333183|gb|FK026512.1|FK026512
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
EST: AATTTATCATGCAACATTCCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTGEST: gi|58014664|gb|CX701406.1|CX701406
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
EST: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCG TTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
genomic: AATTTATCATGCAACATTTCGTGATGGGGCCAGTGGTGGAGTTGCTAGCGgtatctttct ... atgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTG
ttgcagtgcacaaaatcgccatgtttcattaacttggatatttttatgattttagTTTACTATGTGGGACCAAATGGATGGAAGAAACTGTCTGGTGATGATGTTGGGGAACTTCATTACCATTACTACCCAGTTACCCCAAGCACCGTGGAACA
cattaac putative branch site (score: 2)
tttttat putative PPT
attaacttggatattt TA-rich tract