1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtgagtaatcctttctatacctgtacctgtaattttgtttattttttattgctttattttgctcacctcattactccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGGAATGAAACATGAGGGCCGATTACTTATCTGTGTATTAGCTAGAGATAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA13G36690.1 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|209711648|gb|BW671359.1|BW671359
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|58017492|gb|CX704234.1|CX704234
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|192301451|gb|FG998415.1|FG998415
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|9204958|gb|BE331182.1|BE331182
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTNTGGEST: gi|208049710|gb|GD847073.1|GD847073
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|193317756|gb|FK283682.1|FK283682
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: TGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|193487077|gb|FK450518.1|FK450518
genomic: TGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|209709690|gb|BW668226.1|BW668226
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|254316527|gb|GR828064.1|GR828064
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|209712186|gb|BW681392.1|BW681392
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|207690042|gb|GD673611.1|GD673611
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: GAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|209703002|gb|BW656059.1|BW656059
genomic: GAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|209725078|gb|BW659786.1|BW659786
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|207788375|gb|GD763265.1|GD763265
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|209705112|gb|BW653335.1|BW653335
genomic: CCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|208224182|gb|GE021325.1|GE021325
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: GCCAAGCTTGGTGGTAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|213602820|gb|DB978151.1|DB978151
genomic: GCCAAGCTTGGTGG-AGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|193665078|gb|FK612088.1|FK612088
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|208057003|gb|GD851252.1|GD851252
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|213588202|gb|DB984261.1|DB984261
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCAGAAAGTGAATGGCACAAG-CAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|209729014|gb|BW651766.1|BW651766
genomic: CCAGAAAGTGAATGGCAC-TGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|209712343|gb|BW671193.1|BW671193
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|192304319|gb|FG993575.1|FG993575
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATTTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|16997097|gb|BM086469.1|BM086469
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|209720747|gb|BW657749.1|BW657749
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|7146400|gb|AW508322.1|AW508322
genomic: CAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|193457922|gb|FK422876.1|FK422876
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|209721041|gb|BW666298.1|BW666298
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|193324892|gb|FK290190.1|FK290190
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|208279315|gb|GE073606.1|GE073606
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|58022604|gb|CX709345.1|CX709345
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|31474413|gb|CD416441.1|CD416441
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|26058332|gb|CA801246.1|CA801246
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|209719932|gb|BW666015.1|BW666015
genomic: CAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGEST: gi|213588753|gb|DB984322.1|DB984322
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
EST: CCCAGAAAGTGAATGGCTCTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAG TGAGTCCGATGGATGATGGCAGATTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
genomic: CCCAGAAAGTGAATGGCACTGCCAAGCTTGGTGGAGGTGAGGATGCAGAGgtgagtaatc ... ccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGG
aattttgtttattttttattgctttattttgctcacctcattactccttttgcagTGAGTCCGATGGATGATGGAATCTTCCATAGGATTCGATGCATGCGTTTGGGAATGAAACATGAGGGCCGATTACTTATCTGTGTATTAGCTAGAGATAG
tgctcac putative branch site (score: 2)
cctcattactcctttt CT-rich tract
tgtttattttttattg TA-rich tract