1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtaagaacagtatctgcttgttggtttctatgtttgtgcttgtgctgtggtgcatgagtgtatcttgatgcgtttgaaaatatatgtaagcaaatacttaggattgacacagcatttttctggttatgattagGCAGTCATGGAAAGCGAGGGTAAGGTTGGATGGGAAGAAATTGTGGACCCACAATTAAATGGAAAATATGATGTGCATAATCTTCATGACATGGCTTCAC
species | Glycine max |
transcript | GLYMA08G06620.1 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CCACAGCAAGGGCTCATGGAATATGTAAAACTA GCAGTCATGGAAAGCGAGGGTAAGGTTGGATGGGAAGAAATTGTGGACCCAEST: gi|10845425|gb|BF071104.1|BF071104
genomic: CCACAGCAAGGGCTCATGGAATATGTAAAACTAgtaagaacag ... ttatgattagGCAGTCATGGAAAGCGAGGGTAAGGTTGGATGGGAAGAAATTGTGGACCCA
EST: TTATCACTGGCAGGAATCCACAGCAAGGGCTCATGGAATATGTAAAACTA GCAGTCATGGAAAGCGAGGGTAAGGTTGGATGGGAAGAAATTGTGGACCCAEST: gi|16345462|gb|BI971057.1|BI971057
genomic: TTATCACTGGCAGGAATCCACAGCAAGGGCTCATGGAATATGTAAAACTAgtaagaacag ... ttatgattagGCAGTCATGGAAAGCGAGGGTAAGGTTGGATGGGAAGAAATTGTGGACCCA
EST: TTATCACTGGCAGGAATCCACAGCAAGGGCTCATGGAATATGTAAAACTA GCAGTCATGGAAAGCGAGGGTAAGGTTGGATGGGAAGAAATTGTGGACCCAEST: gi|208026987|gb|GD826813.1|GD826813
genomic: TTATCACTGGCAGGAATCCACAGCAAGGGCTCATGGAATATGTAAAACTAgtaagaacag ... ttatgattagGCAGTCATGGAAAGCGAGGGTAAGGTTGGATGGGAAGAAATTGTGGACCCA
EST: ATCACTGGCAGGAATCCACAGCAAGGGCTCATGGAATATGTAAAACTA GCAGTCATGGAAAGCGAGGGTAAGGTTGGATGGGAAGAAATTGTGGACCCAEST: gi|193664890|gb|FK611634.1|FK611634
genomic: ATCACTGGCAGGAATCCACAGCAAGGGCTCATGGAATATGTAAAACTAgtaagaacag ... ttatgattagGCAGTCATGGAAAGCGAGGGTAAGGTTGGATGGGAAGAAATTGTGGACCCA
EST: TTATCACTGGCAGGAATCCACAGCAAGGGCTCATGGAATATGTAAAACTA GCGGTCATGGAAAGCGAGGGTAAGGTTGGATGGGAAGAAATTGTGGACCCAEST: gi|8283551|gb|BE021110.1|BE021110
genomic: TTATCACTGGCAGGAATCCACAGCAAGGGCTCATGGAATATGTAAAACTAgtaagaacag ... ttatgattagGCAGTCATGGAAAGCGAGGGTAAGGTTGGATGGGAAGAAATTGTGGACCCA
EST: TTATCACTGGCAGGAATCCACAGCAAGGGCTCATGGAATATGTAATACTA GCAGTCATGGAAAGCGAGGGTAATGTTGGATGGGAAGAAATTGTGGACCCA
genomic: TTATCACTGGCAGGAATCCACAGCAAGGGCTCATGGAATATGTAAAACTAgtaagaacag ... ttatgattagGCAGTCATGGAAAGCGAGGGTAAGGTTGGATGGGAAGAAATTGTGGACCCA
aatatatgtaagcaaatacttaggattgacacagcatttttctggttatgattagGCAGTCATGGAAAGCGAGGGTAAGGTTGGATGGGAAGAAATTGTGGACCCACAATTAAATGGAAAATATGATGTGCATAATCTTCATGACATGGCTTCAC
gattgac putative branch site (score: 3)
aaatactta TA-rich tract