1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtatgttatgaaaaaaattgtcccataagatatagcaattgaatattcaaggattactattacgattcaaggaaaaagctgtgttttttaattggtgtctctttatatgccacagATTGTCATGGAGCTTCCCATCGAACACGGGTTACTTTTGGACAACCTTTTGGATCTTGCACATGCCCCTTTTACTCACACTTCAACTTTTGCTAAGGGAT
species | Glycine max |
transcript | GLYMA04G42840.1 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTACCCTTCCATCTTTGCTACCTCCATCTGGGTTTGAAGTGCATGCTGAG ATTGTCATGGAGCTTCCCATCGAACACGGGTTACTTGTGGACAACCTTGTGEST: gi|23728713|gb|BU762418.1|BU762418
genomic: CTACCCTTCCATCTTTGCTACCTCCATCTGGGTTTGAAGTGCATGCTGAGgtatgttatg ... tatgccacagATTGTCATGGAGCTTCCCATCGAACACGGGTTACTTTTGGACAACCTTTTG
EST: CTACCCTTCCATCTTTGCTACCTCCATCTGGGTTTGAAGTGCATGCTGAG ATTGTCATGGAGCTTCCCATCGAACACGGGTTACTTTTGTACAACCTTTTGEST: gi|15199646|gb|BI423937.1|BI423937
genomic: CTACCCTTCCATCTTTGCTACCTCCATCTGGGTTTGAAGTGCATGCTGAGgtatgttatg ... tatgccacagATTGTCATGGAGCTTCCCATCGAACACGGGTTACTTTTGGACAACCTTTTG
EST: CTACCCTTCCATCTTTGCTACCTCCATCTGGGTTTGAAGTGCATGCTGAG ATTGTCATGGAGCTTCCCATCGAACACGGGTTACTTTTGGACAACCTTTTGEST: gi|17022892|gb|BM093926.1|BM093926
genomic: CTACCCTTCCATCTTTGCTACCTCCATCTGGGTTTGAAGTGCATGCTGAGgtatgttatg ... tatgccacagATTGTCATGGAGCTTCCCATCGAACACGGGTTACTTTTGGACAACCTTTTG
EST: CTACCCTTCCATCTTTGCTACCTCCATCTGGGTTTGAAGTGCATGCTGAG ATTGTCATGGAGCTTCCCATCGAACACGGGTTACTTTTGGACAACCTTTTG
genomic: CTACCCTTCCATCTTTGCTACCTCCATCTGGGTTTGAAGTGCATGCTGAGgtatgttatg ... tatgccacagATTGTCATGGAGCTTCCCATCGAACACGGGTTACTTTTGGACAACCTTTTG
tacgattcaaggaaaaagctgtgttttttaattggtgtctctttatatgccacagATTGTCATGGAGCTTCCCATCGAACACGGGTTACTTTTGGACAACCTTTTGGATCTTGCACATGCCCCTTTTACTCACACTTCAACTTTTGCTAAGGGAT
ttttaat putative branch site (score: 3)
tctctttat putative PPT
tgtgttttttaatt TA-rich tract