Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtttgcggaatgtgagaagttataacatatttctctagGGGTTGTTTGAGAATGGGAAGGTGGACAAGGCAATGGTGTTGTGGGATGGTTTGACGGAGGCGGATTCTGCTACTTATGGTGTGGTGATTCATGGTTTGT

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA18G42470.1
intron # 5
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

gtttgcggaatgtgagaagttataacatatttctctagGGGTTGTTTGAGAATGGGAAGGTGGACAAGGCAATGGTGTTGTGGGATGGTTTGACGGAGGCGGATTCTGCTACTTATGGTGTGGTGATTCATGGTTTGT
                                    ttataac  putative branch site (score: 2)
                                            tatttctct  CT-rich tract
                                 aagttataacatattt  TA-rich tract