1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gttagtcaattgcattgtattgtaatcatgttcgttgcttctctagtgattcatgaatacaagattttaatgtacttataattataaaacaaggttttatagtttatctataaatttgaaggccattattaatagttatttgtgtaaatgttgcacttgcagGCATAACAAAGCCCTGAATCATCTCTATGATGATGTGGATGAGTTGAATTTCCGAGTGATAGGTGCTAACCAACGTGGACGTCGTTTGCTCGGAAAATAA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA17G08450.1 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTGGGAGAGCTTAAAGGCATGGCTGTTGACATGGGATCCGAGATTGAGAG GCATAACAAAGCCCTGAATCATCTCTATGATGATGTGGATGAGTTGAATTTEST: gi|151403941|gb|EV273751.1|EV273751
genomic: TTGGGAGAGCTTAAAGGCATGGCTGTTGACATGGGATCCGAGATTGAGAGgttagtcaat ... gcacttgcagGCATAACAAAGCCCTGAATCATCTCTATGATGATGTGGATGAGTTGAATTT
EST: TTGGGAGAGCTTAA-GACATGGCTGT-GACATGGGATCCGAGATTGAGAG GCATAACAAAGCCCTGA-TCATCTCTATGEST: gi|14125679|gb|BG790117.1|BG790117
genomic: TTGGGAGAGCTTAAAGGCATGGCTGTTGACATGGGATCCGAGATTGAGAGgttagtcaat ... gcacttgcagGCATAACAAAGCCCTGAATCATCTCTATG
EST: TTGGGAGAGCTTAAAGGCATGGCTGTTGACATGGGATCCGAGATTGAGAG GCATAACAAAGCCCTGAATCATCTCTATGATGATGTGGATGAGTTGAATTTEST: gi|16345689|gb|BI971284.1|BI971284
genomic: TTGGGAGAGCTTAAAGGCATGGCTGTTGACATGGGATCCGAGATTGAGAGgttagtcaat ... gcacttgcagGCATAACAAAGCCCTGAATCATCTCTATGATGATGTGGATGAGTTGAATTT
EST: TTGGGAGAGCTTAAAGGCATGGCTGTTGACATGGGATCCGAGATTGAGAG GCATAACAAAGCCCTGAATCATCTCTATGATGATGTGGATGAGTTGAATTTEST: gi|120492959|gb|EH221126.1|EH221126
genomic: TTGGGAGAGCTTAAAGGCATGGCTGTTGACATGGGATCCGAGATTGAGAGgttagtcaat ... gcacttgcagGCATAACAAAGCCCTGAATCATCTCTATGATGATGTGGATGAGTTGAATTT
EST: TTGGGAGAGCTTAAAGGCATGGCTGTTGACATGGGATCCGAGATTGAGAG GCATAACAAAGCCCTGAATCATCTCTATGATGATGTGGATGAGTTGAATTTEST: gi|16345688|gb|BI971283.1|BI971283
genomic: TTGGGAGAGCTTAAAGGCATGGCTGTTGACATGGGATCCGAGATTGAGAGgttagtcaat ... gcacttgcagGCATAACAAAGCCCTGAATCATCTCTATGATGATGTGGATGAGTTGAATTT
EST: TTGGGAGAGCTTAAAGGCATGGCTGTTGACATGGGATCCGAGATTGAGAG GCATAACAAAGCCCTGAATCATCTCTATGATGATGTGGATGAGTTGAATTT
genomic: TTGGGAGAGCTTAAAGGCATGGCTGTTGACATGGGATCCGAGATTGAGAGgttagtcaat ... gcacttgcagGCATAACAAAGCCCTGAATCATCTCTATGATGATGTGGATGAGTTGAATTT
ctataaatttgaaggccattattaatagttatttgtgtaaatgttgcacttgcagGCATAACAAAGCCCTGAATCATCTCTATGATGATGTGGATGAGTTGAATTTCCGAGTGATAGGTGCTAACCAACGTGGACGTCGTTTGCTCGGAAAATAA
tattaat putative branch site (score: 2)
attattaatagttatt TA-rich tract