1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtttgcttctatttctcatattacatgatagtttttctttcgccactaggattttcatgcatttggctcattttctatttttatttcaacatggaaagttggtgctaatcactattttcctgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGAAACAGGGTCCTAAAACTCCCCTTCCTGATCTTGTCACAATCCACACTC
species | Glycine max |
transcript | GLYMA16G33230.1 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CAGTCAAGGATTACATTGTGACAGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|192304937|gb|FG997091.1|FG997091
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|120494936|gb|EH223103.1|EH223103
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|7326385|gb|AW620194.1|AW620194
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: TCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|23729062|gb|BU762613.1|BU762613
genomic: TCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTCGGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|7028301|gb|AW458084.1|AW458084
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|151396319|gb|EV266196.1|EV266196
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCGAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|192303929|gb|FG995243.1|FG995243
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAEST: gi|37994367|gb|CF806113.1|CF806113
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTA
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|7639366|gb|AW733690.1|AW733690
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|193518116|gb|FK476989.1|FK476989
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|21639077|gb|BM140123.1|BM140123
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTCGGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|192303930|gb|FG995244.1|FG995244
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTTTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|208328152|gb|GE127476.1|GE127476
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|193449304|gb|FK412041.1|FK412041
genomic: CAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|192295866|gb|FG992647.1|FG992647
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTTTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|192305016|gb|FG996134.1|FG996134
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|23726767|gb|BU761386.1|BU761386
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|58025435|gb|CX712176.1|CX712176
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|192326432|gb|FK017704.1|FK017704
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|7284851|gb|AW597338.1|AW597338
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: TCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|58015115|gb|CX701857.1|CX701857
genomic: TCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|58022174|gb|CX708915.1|CX708915
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|13788927|gb|BG651518.1|BG651518
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|192295865|gb|FG992646.1|FG992646
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAG-TTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGEST: gi|58022463|gb|CX709204.1|CX709204
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
EST: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAG GGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
genomic: CAGTCAAGGATTACATTGACTCTGCAGTGAGACATGTCCTCCTAAGACAGgtttgcttct ... tgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGG
tatttttatttcaacatggaaagttggtgctaatcactattttcctgtcttacagGGTGTTCTTGGTATCAAGGTTAAGATCATGCTTGATTGGGATCCTAAAGGGAAACAGGGTCCTAAAACTCCCCTTCCTGATCTTGTCACAATCCACACTC
tgctaat putative branch site (score: 2)
ctattttcctgtctt putative PPT
ttatttcaa TA-rich tract