1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtgggatttggcttttatcattaattggaaggggacagagaatgtttgtttaagcttttcagtgtttgctcaaatgttttgttttgtggatagcatattatttttttgttaattaatgcttcttattgtaatttatgtttttagGCTGGTGTCTTGGCTGGAGATGTCAGCGACATTGTGCTGTTGGATGTCACTCCATTATCTTTGGGTCTGGAAACTCTAGGTGGTGTGATGACAAAAATTA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA16G00410.1 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATGTCACTGTCAATCCAGATGAAGTGGTTGCCCTTGGAGCTGCTGTACAG GCTGGTGTCTTGGCTGGAGATGTCAGCGACATTGTGCTGTTGGATGTCACTEST: gi|193375951|gb|FK342162.1|FK342162
genomic: ATGTCACTGTCAATCCAGATGAAGTGGTTGCCCTTGGAGCTGCTGTTCAGgtgggatttg ... atgtttttagGCTGGTGTCTTGGCTGGAGATGTCAGCGACATTGTGCTGTTGGATGTCACT
EST: ATGTCACTGTCAATCCAGATGAAGTGGTTGCCCTTGGAGCTGCTGTTCAG GCTGGTGTCTTGGCTGGAGATGTCAGCGACATTGTGCTGTTGGATGTCACT
genomic: ATGTCACTGTCAATCCAGATGAAGTGGTTGCCCTTGGAGCTGCTGTTCAGgtgggatttg ... atgtttttagGCTGGTGTCTTGGCTGGAGATGTCAGCGACATTGTGCTGTTGGATGTCACT
atagcatattatttttttgttaattaatgcttcttattgtaatttatgtttttagGCTGGTGTCTTGGCTGGAGATGTCAGCGACATTGTGCTGTTGGATGTCACTCCATTATCTTTGGGTCTGGAAACTCTAGGTGGTGTGATGACAAAAATTA
aattaat putative branch site (score: 3)
tgttttt putative PPT
atattatttttttgtt TA-rich tract