1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtaagtgaaagttcaactacattgattctcatggttcattacctgcaccatggttcttaatatttgcaaatccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGAAAAGTTAACAAGCAGAGAATTGCTTTGACAGACAACTCTATTATTGAA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA15G18170.2 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGEST: gi|17023603|gb|BM094637.1|BM094637
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAG-AGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|298195246|gb|HO043774.1|HO043774
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
ttctcatggttcattacctgcaccatggttcttaatatttgcaaatccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGAAAAGTTAACAAGCAGAGAATTGCTTTGACAGACAACTCTATTATTGAA
tcttaat putative branch site (score: 3)
tccacttc putative PPT
ttaatatttgcaaat TA-rich tract