1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtaagtgaaagttcaactacattgattctcatggttcattacctgcaccatggttcttaatatttgcaaatccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGAAAAGTTAACAAGCAGAGAATTGCTTTGACAGACAACTCTATTATTGAA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA15G18170.1 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|22932168|gb|BU549307.1|BU549307
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|192327716|gb|FK021351.1|FK021351
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|17023603|gb|BM094637.1|BM094637
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|192295535|gb|FG988109.1|FG988109
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|31456852|gb|CD398880.1|CD398880
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTNACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|8282865|gb|BE020426.1|BE020426
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGEST: gi|10232891|gb|BE801779.1|BE801779
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAG-AGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|58021409|gb|CX708150.1|CX708150
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTTCAAGAGGGGCTATGGEST: gi|151400307|gb|EV270121.1|EV270121
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|31306158|gb|CD391361.1|CD391361
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|58015969|gb|CX702711.1|CX702711
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|298195246|gb|HO043774.1|HO043774
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|209728368|gb|BW660006.1|BW660006
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|20815022|gb|BQ299500.1|BQ299500
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|33388304|gb|CA851511.1|CA851511
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|209728367|gb|BW660005.1|BW660005
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|15663868|gb|BI701239.1|BI701239
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|192294770|gb|FG986619.1|FG986619
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|9820878|gb|BE556388.1|BE556388
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|151404968|gb|EV274782.1|EV274782
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|12689954|gb|BG156290.1|BG156290
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|151395296|gb|EV265167.1|EV265167
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|192307998|gb|FG998981.1|FG998981
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|58024451|gb|CX711192.1|CX711192
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTTCAAGAGGGGCTATGGEST: gi|16996376|gb|BM085748.1|BM085748
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|8284546|gb|BE022114.1|BE022114
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|57574809|gb|CX547784.1|CX547784
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGEST: gi|192307999|gb|FG998982.1|FG998982
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
EST: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGG GTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
genomic: AAAGCTACAGTGAATATGCTCCATAGGGTAGAGCCTTATGTTACCTATGGgtaagtgaaa ... tccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGG
ttctcatggttcattacctgcaccatggttcttaatatttgcaaatccacttcagGTACCCTAATTTGAAGAGTGTTAGAGAATTGATCTACAAGAGGGGCTATGGAAAAGTTAACAAGCAGAGAATTGCTTTGACAGACAACTCTATTATTGAA
tcttaat putative branch site (score: 3)
tccacttc putative PPT
ttaatatttgcaaat TA-rich tract