1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
...ttcatgagctgattcgtgttaccatcttcacaaaagaacatgaaaatccttattttaggtggaatggctaatacttgcatcatcattatttgattggcagGAGAATTGTTGGTGTGGCACATGTTGAGGATTTCGAATCCATTACTGATGCTGCTAAACGGGCAAGTTGTGAACGGCGGGCACTTGATTTAGCTAAGATG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA10G40730.1 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CAGATTTTGTTTCACGACAGTCTTGGATTTGGTGCTGCTAAAATTATTAG GAGAATTGTTGGTGTGGCACATGTTGAGGATTTCGAATCCATTACTGATGCEST: gi|254322400|gb|GR837814.1|GR837814
genomic: CAGA-TTTGTTTCACGACAGTCTTGGATTTGGTGCTGCTAAAATTATTAGgtgagacttt ... tgattggcagGAGAATTGTTGGTGTGGCACATGTTGAGGATTTCGAATCCATTACTGATGC
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genomic: ACAGATTTGTTTCACGACAGTCTTGGATTTGGTGCTGCTAAAATTATTAGgtgagacttt ... tgattggcagGAGAATTGTTGGTGTGGCACATGTTGAGGATTTCGAATCCATTACTGATGC
EST: ACAGATTTGTTTCACGACAGTCTTGGATTTGGTGCTGCTAAAATTATTAG GAGAATTGTTGGTGTGGCACATGTTGAGGATTTCGAATCCATTACTGATGCEST: gi|213592063|gb|DB983275.1|DB983275
genomic: ACAGATTTGTTTCACGACAGTCTTGGATTTGGTGCTGCTAAAATTATTAGgtgagacttt ... tgattggcagGAGAATTGTTGGTGTGGCACATGTTGAGGATTTCGAATCCATTACTGATGC
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genomic: ACAGATTTGTTTCACGACAGTCTTGGATTTGGTGCTGCTAAAATTATTAGgtgagacttt ... tgattggcagGAGAATTGTTGGTGTGGCACATGTTGAGGATTTCGAATCCATTACTGATGC
EST: ACAGATTTGTTTCACGACAGTCTTGGATTTGGTGCTGCTAAAATTATTAG GAGAATTGTTGGTGTGGCACATGTTGAGGATTTCGAATCCATTACTGACCCEST: gi|27423492|gb|CA935012.1|CA935012
genomic: ACAGATTTGTTTCACGACAGTCTTGGATTTGGTGCTGCTAAAATTATTAGgtgagacttt ... tgattggcagGAGAATTGTTGGTGTGGCACATGTTGAGGATTTCGAATCCATTACTGATGC
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atccttattttaggtggaatggctaatacttgcatcatcattatttgattggcagGAGAATTGTTGGTGTGGCACATGTTGAGGATTTCGAATCCATTACTGATGCTGCTAAACGGGCAAGTTGTGAACGGCGGGCACTTGATTTAGCTAAGATG
atcattatttgatt TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ttcatgagctgattcgtgttaccatcttcacaaaagaacatgaaaatccttattttaggtggaatggctaatacttgcatcatcattatttgattggcagGAGAATTGTTGGTGTGGCACATGTTGAGGATTTCGAATCCATTACTGATGCTGCTAAACGGGCAAGTTGTGAACGGCGGGCACTTGATTTAGCTAAGATG
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