1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' |
...ctgcattttgcatcatacagtccactttctatgatctgattttttttatgtgttgtttttttattgtaactaaaacatgttcatttctgttgtgcttcagGATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTCTGTGGTAACTGTGTTGTGTG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA09G08150.2 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AGGAATAGTTGGTGTAATCACTGCTTTCAACTTTCCATGCGCTGTTCTAG GATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTCTGTGGTAACTGTGTTGTGTGEST: gi|193367841|gb|FK333423.1|FK333423
genomic: AGGAATAGTTGGTGTAATCAGTGCTTTCAACTTTCCATGCGCTGTTCTAGgtatgtattt ... tgtgcttcagGATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTCTGTGGTAACTGTGTTGTGTG
EST: AGGAATAGTTGGTGTAATCACTGCTTTCAACTTTCCATGCGCTGTTCTAG GATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTCTGTGGTAACTGTGTTGTGTGEST: gi|208034630|gb|GD836794.1|GD836794
genomic: AGGAATAGTTGGTGTAATCAGTGCTTTCAACTTTCCATGCGCTGTTCTAGgtatgtattt ... tgtgcttcagGATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTCTGTGGTAACTGTGTTGTGTG
EST: AGGAATAGTTGGTGTAATCACTGCTTTCAACTTTCCATGCGCTGTTCTAG GATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTEST: gi|254341577|gb|GR852714.1|GR852714
genomic: AGGAATAGTTGGTGTAATCAGTGCTTTCAACTTTCCATGCGCTGTTCTAGgtatgtattt ... tgtgcttcagGATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGT
EST: AGGAATAGTTGGTGTAATCAGTGCTTTCAACTTTCCATGCGCTGTTCTAG GATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTCTGTGGTAACTGTGTTGTGTGEST: gi|16347961|gb|BI973556.1|BI973556
genomic: AGGAATAGTTGGTGTAATCAGTGCTTTCAACTTTCCATGCGCTGTTCTAGgtatgtattt ... tgtgcttcagGATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTCTGTGGTAACTGTGTTGTGTG
EST: ATGAATAGTTGGTGTAATCAGTGCTTTCAACTTTCCATGCGCTGTTCTAG GATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTCTGTGATAACTGTGTTGTGTGEST: gi|12489527|gb|BG043049.1|BG043049
genomic: AGGAATAGTTGGTGTAATCAGTGCTTTCAACTTTCCATGCGCTGTTCTAGgtatgtattt ... tgtgcttcagGATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTCTGTGGTAACTGTGTTGTGTG
EST: ATGAATAGTTGGTGTAATCACTGCTTTCAACTTTCCATGCGCTGTTCTAG GATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTCTGTGGTAACTGTGTTGTGTGEST: gi|6668020|gb|AW279471.1|AW279471
genomic: AGGAATAGTTGGTGTAATCAGTGCTTTCAACTTTCCATGCGCTGTTCTAGgtatgtattt ... tgtgcttcagGATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTCTGTGGTAACTGTGTTGTGTG
EST: AGGAATAGTTGGTGTAATCAGTGCTTTCAACTTTCCATGCGCTGTTCTAG GATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTCTGTGGTAACTGTGTTGTGTGEST: gi|19938590|gb|BQ081792.1|BQ081792
genomic: AGGAATAGTTGGTGTAATCAGTGCTTTCAACTTTCCATGCGCTGTTCTAGgtatgtattt ... tgtgcttcagGATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTCTGTGGTAACTGTGTTGTGTG
EST: CCATGCGCTGTTCTAG GATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTCTGTGGTAACTGTGTTGTGTGEST: gi|193455585|gb|FK418764.1|FK418764
genomic: CCATGCGCTGTTCTAGgtatgtattt ... tgtgcttcagGATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTCTGTGGTAACTGTGTTGTGTG
EST: AGGAATAGTTGGTGTAATCACTGCTTTCAACTTTCCATGCGCTGTTCTAG GATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTCTGTGGTAACTGTGTTGTGTGEST: gi|27427065|gb|CA938585.1|CA938585
genomic: AGGAATAGTTGGTGTAATCAGTGCTTTCAACTTTCCATGCGCTGTTCTAGgtatgtattt ... tgtgcttcagGATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTCTGTGGTAACTGTGTTGTGTG
EST: AGGAATAGTTGGTGTAATCACTGCTTTCAACTTTCCATGCGCTGTTCTAG GATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTCTGTGGTAACTGTGTTGTGTG
genomic: AGGAATAGTTGGTGTAATCAGTGCTTTCAACTTTCCATGCGCTGTTCTAGgtatgtattt ... tgtgcttcagGATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTCTGTGGTAACTGTGTTGTGTG
ttatgtgttgtttttttattgtaactaaaacatgttcatttctgttgtgcttcagGATGGAATGCTTGCATTGCTTTAGTCTGTGGTAACTGTGTTGTGTG
aactaaa putative branch site (score: 2)
tttctgtt putative PPT
ttgtttttttattgta TA-rich tract