1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtaagaaacattttttttttttagttttaaatgcttcagaatcttatcaacattctttcattaaccttgaagtttatcattatattttcttatcgtttcagTCAATGATTGGTCATGGTCTTGGGGCTGCTGGTGGTTTGGAAGCCATAGCAACTATCAAAGCCATAACAACTGGCTGGTTGCATCCAAGCATTAACCTAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA08G02850.2 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTAAAAAGGTTTTTAAGGACACATCAGAATTGAAAATGAATGCAACTAAG TCAATGATTGGTCATGGTCTTGGGGCTGCTGGTGGTTTGGAAGCCATAGCAEST: gi|58018638|gb|CX705380.1|CX705380
genomic: TTAAAAAGGTTTTTAAGGACACATCAGAATTGAAAATGAATGCAACTAAGgtaagaaaca ... atcgtttcagTCAATGATTGGTCATGGTCTTGGGGCTGCTGGTGGTTTGGAAGCCATAGCA
EST: TTAAAAAGGTTTTTAAGGACACATCAGAATTGAAAATGAATGCAACTAAG TCAATGATTGGTCATGGTCTTGGGGCTGCTGGTGGTTTGGAAGCCATAGCA
genomic: TTAAAAAGGTTTTTAAGGACACATCAGAATTGAAAATGAATGCAACTAAGgtaagaaaca ... atcgtttcagTCAATGATTGGTCATGGTCTTGGGGCTGCTGGTGGTTTGGAAGCCATAGCA
tcaacattctttcattaaccttgaagtttatcattatattttcttatcgtttcagTCAATGATTGGTCATGGTCTTGGGGCTGCTGGTGGTTTGGAAGCCATAGCAACTATCAAAGCCATAACAACTGGCTGGTTGCATCCAAGCATTAACCTAG
cattaac putative branch site (score: 2)
ttttcttatcgtttc putative PPT
ttgaagtttatcatta TA-rich tract