1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtaagcttgctttaatatatgtcaactgtaggagtgatgtaactttggtggtttattcagttctcctttatcttataatacgtgtccatgttagctactagcactgtaatgggttgtttatattatgcttacctttttaaaatatgcagGTGATTCTCAATGATCCCTTCCTTGGCAAAAGAGTTGAAGAAAGCAACTTTTCAACTGTACCACTAAGGGATGAGTTCCTTGAAAATGCTAGGCTATTTA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA02G33770.1 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCAACTATGATTTTGATGGCGCACAAAAGAAGATGAGGGAATGTGAAGAA GTGATTCTCAAEST: gi|151408544|gb|EV278352.1|EV278352
genomic: TCAACTATGATTTTGATGGGGCACAAAAGAAGATGAGGGAATGTGAAGAAgtaagcttgc ... aaatatgcagGTGATTCTCAA
EST: TCAACTATGATTTTGATGGGGCACAAAAGAAGATGAGGGAATGTGAAGAA GTGATTCTCAATGATCCCTTCCTTGGCAAAAGAGTTGAAGAAAGCAACTTTEST: gi|57575424|gb|CX548399.1|CX548399
genomic: TCAACTATGATTTTGATGGGGCACAAAAGAAGATGAGGGAATGTGAAGAAgtaagcttgc ... aaatatgcagGTGATTCTCAATGATCCCTTCCTTGGCAAAAGAGTTGAAGAAAGCAACTTT
EST: TCAACTATGATTTTGATGGGGCACAAAAGAAGATGAGGGAATGTGAAGAA GTGATTCTCAATGATCCCTTCCTTGGCAAAAGAGTTGAAGAAAGCAACTTTEST: gi|193530321|gb|FK483720.1|FK483720
genomic: TCAACTATGATTTTGATGGGGCACAAAAGAAGATGAGGGAATGTGAAGAAgtaagcttgc ... aaatatgcagGTGATTCTCAATGATCCCTTCCTTGGCAAAAGAGTTGAAGAAAGCAACTTT
EST: TCAACTATGATTTTGATGGGGCACAAAAGAAGATGAGGGAATGTGAAGAA GTGATTCTCAATGATCCCTTCCTTGGCAAAAGAGTTGAAGAAAGCAACTTT
genomic: TCAACTATGATTTTGATGGGGCACAAAAGAAGATGAGGGAATGTGAAGAAgtaagcttgc ... aaatatgcagGTGATTCTCAATGATCCCTTCCTTGGCAAAAGAGTTGAAGAAAGCAACTTT
ctactagcactgtaatgggttgtttatattatgcttacctttttaaaatatgcagGTGATTCTCAATGATCCCTTCCTTGGCAAAAGAGTTGAAGAAAGCAACTTTTCAACTGTACCACTAAGGGATGAGTTCCTTGAAAATGCTAGGCTATTTA
tgcttac putative branch site (score: 2)
tttatattatgcttac TA-rich tract