1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
...gagatctttctctttctgttcattttttagtcaagcaataaaatttctcttattttctctctacttccttcatgggttcctcgcacacttactttttcagGATTTGTCTGGCCGACCACATCTAAGTTATAATTTGGACATACCCACTCAGAGGGTTGGGACATATGATACTCAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA20G28420.2 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
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EST: CATTGATACATGTTTCACTG GATTTGTCTGGCCGACCACATCTAAGTTATAATTTGGACATACCCACTCAGEST: gi|192295567|gb|FG988141.1|FG988141
genomic: CATTGATACATGTTTCACTGgtaattttca ... actttttcagGATTTGTCTGGCCGACCACATCTAAGTTATAATTTGGACATACCCACTCAG
EST: TTGGTAACTTCTCTGCTCCTCTTGATGAAGCATTGATACATGTTTCACTG GATTTGTCTGGCCGACCACATCTAAGTTATAATTTGGACATACCCACTCAGEST: gi|120528949|gb|EH257083.1|EH257083
genomic: TTGGTAACTTCTCTGCTCCTCTTGATGAAGCATTGATACATGTTTCACTGgtaattttca ... actttttcagGATTTGTCTGGCCGACCACATCTAAGTTATAATTTGGACATACCCACTCAG
EST: TAGGTAACTTCTCTGCTCCTCTTGATGAAGCATTGATACATGTATCACTG GATTTGTCTGGCCGAACACATCTAAG
genomic: TTGGTAACTTCTCTGCTCCTCTTGATGAAGCATTGATACATGTTTCACTGgtaattttca ... actttttcagGATTTGTCTGGCCGACCACATCTAAG
tctcttattttctctctacttccttcatgggttcctcgcacacttactttttcagGATTTGTCTGGCCGACCACATCTAAGTTATAATTTGGACATACCCACTCAGAGGGTTGGGACATATGATACTCAG
cacttac putative branch site (score: 2)
cttactttttc CT-rich tract
ttacttttt TA-rich tract