1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtgagtctattttcatcctaaaatcattggcattgcaaatgtttattgttgttgtagagtattcatactgtgtatctgacttctagaataagctgcttgtactgctattagcttatatatgcgagcttttagcccctttcaatcataaaaaaagaagaagcttatatatgctcattttattattttaatgtttcagGCCCACATTGAACAGTGGATTGATTTTTCATCATTGGAGATTGATGCTAATATTATCAAGTGGTATGCCCCAAGAGTTGGACGAGGACCATATCTTCCTC
species | Glycine max |
transcript | GLYMA17G00470.4 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CCCGGCTGAAAGGTGATAACACTTTGTATGGATCTTCCTTGATTGAATAT GCCCACATTGAACAGTGGATTGATTTTTCATCATTGGAGATTGATGCTAATEST: gi|208029666|gb|GD832044.1|GD832044
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EST: CCCGGCTGAAAGGTGATAACACTTTGTATGGATCTTCCTTGATTGAATAT GCCCACATTGAACAAG-GGATTGATTTTTCATCATTGGAGATTGATGCTAAEST: gi|7795385|gb|AW780844.1|AW780844
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EST: CTTGATTGAATAT GCCCACATTGAACAGTGGATTGATTTTTCATCATTGGAGATTGATGCTAATEST: gi|208268375|gb|GE067690.1|GE067690
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genomic: TCTTCCTTGATTGAATATgtgagtctat ... aatgtttcagGCCCACATTGAACAGTGGATTGATTTTTCATCATTGGAGATTGATGCTAAT
atcataaaaaaagaagaagcttatatatgctcattttattattttaatgtttcagGCCCACATTGAACAGTGGATTGATTTTTCATCATTGGAGATTGATGCTAATATTATCAAGTGGTATGCCCCAAGAGTTGGACGAGGACCATATCTTCCTC
ttttaat putative branch site (score: 3)
ttatatatgctcattt TA-rich tract