1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtgctgtgttcatgaggaattccttcctctcccaccctcgtctcactcagttttttttaaactcttgtctcatgttttaatatctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAATGGATGAGGAGTATGAAGGAAATGTTGAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA13G35590.1 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|13181447|gb|BG352787.1|BG352787
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAT CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|298175002|gb|HO017997.1|HO017997
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTCGAAAEST: gi|26058921|gb|CA801835.1|CA801835
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|42722709|gb|CK768608.1|CK768608
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|37993992|gb|CF805738.1|CF805738
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|298185668|gb|HO030881.1|HO030881
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|209721139|gb|BW665696.1|BW665696
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|213588681|gb|DB957689.1|DB957689
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAGAACACTTGAAAEST: gi|213593969|gb|DB961913.1|DB961913
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|15203735|gb|BI426503.1|BI426503
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|37993873|gb|CF805619.1|CF805619
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|19452678|gb|BM954088.1|BM954088
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|6502066|gb|AW203439.1|AW203439
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|213611688|gb|DB969076.1|DB969076
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|17153260|gb|BM143193.1|BM143193
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACTTTTGAAAEST: gi|7326863|gb|AW620661.1|AW620661
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|15812318|gb|BI784593.1|BI784593
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|8282845|gb|BE020406.1|BE020406
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|192305243|gb|FG993981.1|FG993981
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|7590367|gb|AW706121.1|AW706121
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|209711827|gb|BW674087.1|BW674087
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|9900404|gb|BE609372.1|BE609372
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|213608827|gb|DB957191.1|DB957191
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|23727797|gb|BU761934.1|BU761934
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|18733428|gb|BM527602.1|BM527602
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|254328305|gb|GR835270.1|GR835270
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|298195414|gb|HO039245.1|HO039245
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|6072796|gb|AW102183.1|AW102183
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|254332683|gb|GR844053.1|GR844053
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|163921337|gb|EH039759.1|EH039759
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|298177039|gb|HO023400.1|HO023400
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|19269197|gb|BM885453.1|BM885453
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|213619435|gb|DB963401.1|DB963401
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|20498035|gb|BQ272965.1|BQ272965
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|46492910|gb|CN472466.1|CN472466
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|8284697|gb|BE022239.1|BE022239
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|23731241|gb|BU763733.1|BU763733
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|13562903|gb|BG551123.1|BG551123
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGACTAGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|14125882|gb|BG790320.1|BG790320
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|4286000|gb|AI440984.1|AI440984
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|192318939|gb|FK006835.1|FK006835
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|38192978|gb|CF922184.1|CF922184
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|11412751|gb|BF424762.1|BF424762
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|213607717|gb|DB958736.1|DB958736
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|209710634|gb|BW671006.1|BW671006
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|7326861|gb|AW620659.1|AW620659
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|18692881|gb|BM521729.1|BM521729
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|9440322|gb|BE440829.1|BE440829
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|15812394|gb|BI784669.1|BI784669
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|254316214|gb|GR827751.1|GR827751
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|298183188|gb|HO028451.1|HO028451
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|48575154|gb|CO036261.1|CO036261
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|17022274|gb|BM093308.1|BM093308
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|18040880|gb|BM309174.1|BM309174
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|208298056|gb|GE091031.1|GE091031
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|12773942|gb|BG238869.1|BG238869
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: GAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACCAATTATGCCA-CAN CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTTCTCAAAACACTTGAAEST: gi|213614228|gb|DB956812.1|DB956812
genomic: GAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGC-AGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|24205594|gb|BU964847.1|BU964847
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|193626317|gb|FK572681.1|FK572681
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: CTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|213619814|gb|DB969478.1|DB969478
genomic: CTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|18041137|gb|BM309431.1|BM309431
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|209716540|gb|BW653902.1|BW653902
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|298183179|gb|HO028442.1|HO028442
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|213601355|gb|DB956675.1|DB956675
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|298183338|gb|HO028551.1|HO028551
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|254320081|gb|GR830997.1|GR830997
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|209710047|gb|BW681039.1|BW681039
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|254319372|gb|GR828992.1|GR828992
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|6070850|gb|AW100237.1|AW100237
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCANAACACTTGAAAEST: gi|298185362|gb|HO030575.1|HO030575
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|213617258|gb|DB972896.1|DB972896
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|208340211|gb|GE135787.1|GE135787
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACATATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTTTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|7590322|gb|AW706077.1|AW706077
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAAEST: gi|26267787|gb|CA818850.1|CA818850
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
EST: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAG CTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
genomic: TGAGCTGCCACGATATGGTCTTGAAGTAGGACTTACAAATTATGCAGCAGgtgctgtgtt ... ctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAA
cgtctcactcagttttttttaaactcttgtctcatgttttaatatctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAATGGATGAGGAGTATGAAGGAAATGTTGAG
ttttaat putative branch site (score: 3)
ttttttttaaactctt TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| gtgctgtgttcatgaggaattccttcctctcccaccctcgtctcactcagttttttttaaactcttgtctcatgttttaatatctgtgtccagCTTATTGCACTGGTCTCCTGTTGGCCCGAAGAGTCCTCAAAACACTTGAAATGGATGAGGAGTATGAAGGAAATGTTGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGGAA