1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtaaactattttccctgcacttgattttgactattccaattggcagccgattattgtaattgttctaatgtataatggtatgttgccagGGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCCAAAAAACGTGTATCAGCCACATCAATTTATTTTGAATCTATGCCTTATC
species | Glycine max |
transcript | GLYMA13G29410.2 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTAATTTTGCAGTATACACTGCAGTTCTTAAACCACATGATCGGATAATG GGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCCEST: gi|207847529|gb|GD820122.1|GD820122
genomic: CTAATTTTGCAGTATACACTGCAGTTCTTAAACCACATGATCGGATAATGgtaaactatt ... atgttgccagGGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCC
EST: TTCTTAAACCACATGATCGGATAATG GGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCCEST: gi|209729807|gb|BW658612.1|BW658612
genomic: TTCTTAAACCACATGATCGGATAATGgtaaactatt ... atgttgccagGGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCC
EST: CTAATTTTGCAGTATACACTGCAGTTCTTAAACCACATGATCGGATAATG GGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCCEST: gi|5753603|gb|AI960890.1|AI960890
genomic: CTAATTTTGCAGTATACACTGCAGTTCTTAAACCACATGATCGGATAATGgtaaactatt ... atgttgccagGGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCC
EST: CTAATTTTGCAGTATACACTGCAGTTCTTAAACCACATGATCGGATAATG GGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCCEST: gi|193680055|gb|FK622379.1|FK622379
genomic: CTAATTTTGCAGTATACACTGCAGTTCTTAAACCACATGATCGGATAATGgtaaactatt ... atgttgccagGGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCC
EST: CTAATTTTGCAGTATACACTGCAGTTCTTAAACCACATGATCGGATAATG GGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCCEST: gi|192301792|gb|FG994444.1|FG994444
genomic: CTAATTTTGCAGTATACACTGCAGTTCTTAAACCACATGATCGGATAATGgtaaactatt ... atgttgccagGGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCC
EST: CTAATTT-GCAGTATACACTGCAGT-CT-AAAC-ACATGATCGGATAATG GGTTTGGACTTGCCTCACGEST: gi|18039880|gb|BM308174.1|BM308174
genomic: CTAATTTTGCAGTATACACTGCAGTTCTTAAACCACATGATCGGATAATGgtaaactatt ... atgttgccagGGTTTGGACTTGCCTCACG
EST: CTAATTTTGCAGTATACACTGCAGTTCTTAAACCACATGATCGGATAATG GGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCCEST: gi|254335574|gb|GR847102.1|GR847102
genomic: CTAATTTTGCAGTATACACTGCAGTTCTTAAACCACATGATCGGATAATGgtaaactatt ... atgttgccagGGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCC
EST: CTAATTTTGCAGTATACACTGCAGTTCTTAAACCACATGATCGGATAATG GGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCCEST: gi|254345539|gb|GR851701.1|GR851701
genomic: CTAATTTTGCAGTATACACTGCAGTTCTTAAACCACATGATCGGATAATGgtaaactatt ... atgttgccagGGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCC
EST: CTAATTTTGCAGTATACACTGCAGTTCT-AAACCACATGATCGGATAATG GGTTTGGACTTGCCTCACEST: gi|298190143|gb|HO032264.1|HO032264
genomic: CTAATTTTGCAGTATACACTGCAGTTCTTAAACCACATGATCGGATAATGgtaaactatt ... atgttgccagGGTTTGGACTTGCCTCAC
EST: CTAATTTTGCAGTATACACTGCAGTTCTTAAACCACATGATCGGATAATG GGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCCEST: gi|151395198|gb|EV265069.1|EV265069
genomic: CTAATTTTGCAGTATACACTGCAGTTCTTAAACCACATGATCGGATAATGgtaaactatt ... atgttgccagGGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCC
EST: CTAATTTTGCAGTATACACTGCAGTTCTTAAACCACATGATCGGATAATG GGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCCEST: gi|208209797|gb|GE004404.1|GE004404
genomic: CTAATTTTGCAGTATACACTGCAGTTCTTAAACCACATGATCGGATAATGgtaaactatt ... atgttgccagGGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCC
EST: TTCTTAAACCACATGTATTCGGTATTAATG GGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCEST: gi|208324186|gb|GE121441.1|GE121441
genomic: TTCTTAAACCACATG-A-TCGG-A-TAATGgtaaactatt ... atgttgccagGGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACC
EST: TTCTTAAAACCACATGATCGGATAATG GGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCC
genomic: TTCTT-AAACCACATGATCGGATAATGgtaaactatt ... atgttgccagGGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCC
tccaattggcagccgattattgtaattgttctaatgtataatggtatgttgccagGGTTTGGACTTGCCTCACGGAGGACATTTGTCTCATGGATTCATGACACCCAAAAAACGTGTATCAGCCACATCAATTTATTTTGAATCTATGCCTTATC
ttctaat putative branch site (score: 2)
attattgtaattgttc TA-rich tract