1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtaatattggtgaacttgatgtatgagaaaactgcatttggaaatacttagtatttggaaattaatgatattggttatttttctgaccttccgcagCTTGTGAAGAATCCTGCACTTTTCGATGTACTAGTGATGCCTAACCTTTATGGTGATATTATTAGTGACCTTTGTGCTGGCTTGGTTGGGGGATTGGGTT
species | Glycine max |
transcript | GLYMA13G20790.1 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATCCTGAGATAACTTATGAGGAAGTTGTCATTGACAATTGCTGCATGATG CTTGTGAAGAATCCTGCACTTTTCGATGTACTAGTGATGCCTAACCTTTATEST: gi|21677612|gb|BQ629963.1|BQ629963
genomic: ATCCTGAGATAACTTATGAGGAAGTTGTCATTGACAATTGCTGCATGATGgtaatattgg ... ccttccgcagCTTGTGAAGAATCCTGCACTTTTCGATGTACTAGTGATGCCTAACCTTTAT
EST: ATCCTGAGATAACTTATGAGGAAGTTGTCATTGACAATTGCTGCATGATG CTTGTGAAGAATCCTGCACTTTTCGATGTACTATTGATGCCTAACCTTTATEST: gi|254321137|gb|GR827586.1|GR827586
genomic: ATCCTGAGATAACTTATGAGGAAGTTGTCATTGACAATTGCTGCATGATGgtaatattgg ... ccttccgcagCTTGTGAAGAATCCTGCACTTTTCGATGTACTAGTGATGCCTAACCTTTAT
EST: ATCCTGAGATAACTTATGAGGAAGTTGTCATTGACAATTGCTGCATGATG CTTGTGAAGAATCCTGCACTTTTCGATGTACTAGTGATGCCTAACCTTTATEST: gi|7924579|gb|AW830605.1|AW830605
genomic: ATCCTGAGATAACTTATGAGGAAGTTGTCATTGACAATTGCTGCATGATGgtaatattgg ... ccttccgcagCTTGTGAAGAATCCTGCACTTTTCGATGTACTAGTGATGCCTAACCTTTAT
EST: ATCCTGAGATAACTTATGAGGAAGTTGTCATTGACAATTGCTGCATGATG CTTGTGAAGAATCCTGCACTTTTCGATGTACTAGTGATGCCTAACCTTTAT
genomic: ATCCTGAGATAACTTATGAGGAAGTTGTCATTGACAATTGCTGCATGATGgtaatattgg ... ccttccgcagCTTGTGAAGAATCCTGCACTTTTCGATGTACTAGTGATGCCTAACCTTTAT
aaatacttagtatttggaaattaatgatattggttatttttctgaccttccgcagCTTGTGAAGAATCCTGCACTTTTCGATGTACTAGTGATGCCTAACCTTTATGGTGATATTATTAGTGACCTTTGTGCTGGCTTGGTTGGGGGATTGGGTT
ttctgac putative branch site (score: 2)
tttttctgaccttcc CT-rich tract
aaattaatgatattgg TA-rich tract