1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gtgattattttatcatgaattagctctttcgtgtgtgccattttcattgaatgctaaaaaaaatgttgtggttttgcagATGTGGATTTCTAAAGGTGAATATGATGAGTCTGGCCCATCCATTGTCCACAGGAAGTGCTTCTAACTTCTAAGTACAAAATATGCTTCAATGGTGAATT
species | Glycine max |
transcript | GLYMA08G15480.1 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTGTCTGGATTGGAGGATCAATCCTTGCATCCCTCAGCACCTTCCAGCAG ATGTGGATTTCTAAAGGTGAATATGATGAGTCTGGCCCATCCATTGTCCACEST: gi|26049076|gb|CA785529.1|CA785529
genomic: GTGTCTGGATTGGAGGATCAATCCTTGCATCCCTCAGCACCTTCCAGCAGgtgattattt ... ggttttgcagATGTGGATTTCTAAAGGTGAATATGATGAGTCTGGCCCATCCATTGTCCAC
EST: GTGTCTGGATTGGAGGATCAATCCTTGCATCCCTCAGCACCTTCCAGCAG ATGTGGATTTCTAAAGGTGAATATGATGAGTCTGGCCCATCCATTGTCCACEST: gi|12774552|gb|BG239479.1|BG239479
genomic: GTGTCTGGATTGGAGGATCAATCCTTGCATCCCTCAGCACCTTCCAGCAGgtgattattt ... ggttttgcagATGTGGATTTCTAAAGGTGAATATGATGAGTCTGGCCCATCCATTGTCCAC
EST: GTGTCTGGATTGGAGGATCAATCCTTGCATCCCTCAGCACCTTCCAGCAG ATGTGGATTTCTAAAG-TGAATATGATGAGTCTGGCCCATCCATTGTCCAC
genomic: GTGTCTGGATTGGAGGATCAATCCTTGCATCCCTCAGCACCTTCCAGCAGgtgattattt ... ggttttgcagATGTGGATTTCTAAAGGTGAATATGATGAGTCTGGCCCATCCATTGTCCAC
tctttcgtgtgtgccattttcattgaatgctaaaaaaaatgttgtggttttgcagATGTGGATTTCTAAAGGTGAATATGATGAGTCTGGCCCATCCATTGTCCACAGGAAGTGCTTCTAACTTCTAAGTACAAAATATGCTTCAATGGTGAATT
tgctaaa putative branch site (score: 2)
aatgctaaaaaaaat TA-rich tract