Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtatgtctatatatacttttttttgcttttccatatggctatttcatgccaactgtttccaaattaatttaactgaaatttttttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAATCAAGCACAGAAGCAAAGACGCCGAACATACCGAGCCCATGGAAGAATCA

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA08G10910.2
intron # 4
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA08G10910.2 (Glycine max), 3'ss of exon 4
lower sequence: AT1G27400.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 4
gtatgtctatatatacttttttttgcttttccatatggctatttcatgccaactgtttccaaattaatttaactgaaatttttttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAATCAAGCACAGAAGCAAAGACGCCGAACATACCGAGCCCATGGAAGAATCA
|| ||  | ||   ||| |||||   || |    ||||  |||| | |  |   ||| | |||    |||     |||   |||  || |||||| |||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||| || ||||||   || || ||  |  | ||||| || || |||||||||||||
gt-tggttttacg-actctttttgttttgttgccatggtgatttta-gtta---gttactaaaactttttgt---aaaccatttggttatcagGTCAAAGGTTTGGATGTCGATGCCCTTTTCATTTCTCACATCCAAGTGAACCAAGCAGCAAAACAGAGGAGAAGGACATATCGTGCTCATGGAAGAATCA

upper sequence: GLYMA08G10910.2 (Glycine max), 3'ss of exon 4
lower sequence: AT1G67430.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 4
-----gtatgtctatatatacttttttttgcttttccatatggctatttcatgccaactgtttccaaattaatttaactgaaatttttttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAATCAAGCACAGAAGCAAAGACGCCGAACATACCGAGCCCATGGAAGAATCA
         |  |  || || ||       ||||| | | |  || | |      | |  ||| | ||| |   ||  |  |   |||   | |||||||||||||||||||||||||||| || | ||| || || |||||||| || || ||    ||||||||  |  | || ||||| || || ||||||||||
gtgagacgagcattcatttaattaaggaaactttttcttgtttctctct----gtacccttttgctaataagcatattttga--ctttgaatgttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCCCTCTTCATATCACACATCCAAGTGAACCAGGCCGCAAAGCAAAGGAGAAGGACTTACCGTGCTCACGGAAGAATCA

upper sequence: GLYMA08G10910.2 (Glycine max), 3'ss of exon 4
lower sequence: Vv01s0010g03380.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
gtatgtctatatatacttttttttgcttttccatatggctatttcatgccaactgtttccaaattaatttaactga--aatttttttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAATCAAGCACAGAAGCAAAGACGCCGAACATACCGAGCCCATGGAAGAATCA
           |||   ||   ||||  |||   |||  ||||   |||    ||| |  || |  |  ||||| |  ||| |   |  || ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||
----------gtatgtattcaattgcccttcaccatg--tattctctgct--ttgtctataattccaactaactaataaatgtcaattcttacagTTGAAAGGTCTGGATGTTGATTCACTCTACATATCTCACATCCAAGTGAACCAGGCACAGAAACAAAGGCGCCGCACATACCGGGCTCATGGAAGAATCA

upper sequence: GLYMA08G10910.2 (Glycine max), 3'ss of exon 4
lower sequence: Vv01s0010g03370.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 5
-----------gtatgtctatatatacttttttttgcttttccatatggctatttcatgccaactgtttc-caaattaatttaactga--aatttttttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAATCAAGCACAGAAGCAAAGACGCCGAACATACCGAGCCCATGGAAGAATCA
           || || |  |    |  | || | |  |||   ||| ||   ||       |  | ||     |||    | ||| |  ||| |   |  || ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||
gtatgtatttcgt-tgcccttcaccatgtattctcggctttatttatagccccttttgatagatagctttatttattgcccttactaataaatgtcaattcttacagTTGAAAGGTCTGGATGTTGATTCACTCTACATATCTCACATCCAAGTGAACCAGGCACAGAAACAAAGGCGCCGCACATACCGTGCTCATGGAAGAATCA

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|298180950|gb|HO022389.1|HO022389
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|8827548|gb|BE211278.1|BE211278
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|192311078|gb|FK004753.1|FK004753
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|298163564|gb|HO012297.1|HO012297
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTGCATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|308098912|gb|HO760753.1|HO760753
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGT
EST: gi|151396569|gb|EV266446.1|EV266446
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTACGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|4293582|gb|AI442068.1|AI442068
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTG-ATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|31468876|gb|CD410904.1|CD410904
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|213601853|gb|DB982578.1|DB982578
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|208150482|gb|GD950877.1|GD950877
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATG
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATG
EST: gi|298163269|gb|HO012002.1|HO012002
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|209710236|gb|BW658932.1|BW658932
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|10845955|gb|BF068960.1|BF068960
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|192311077|gb|FK004752.1|FK004752
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|298163590|gb|HO012323.1|HO012323
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|298191555|gb|HO039034.1|HO039034
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|13789287|gb|BG651878.1|BG651878
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|298187459|gb|HO034608.1|HO034608
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAT                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCGAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|19052522|gb|BM731189.1|BM731189
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|7795640|gb|AW781037.1|AW781037
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCTTATCCAAGTCATT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|192334610|gb|FK025185.1|FK025185
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|13311603|gb|BG405254.1|BG405254
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|19269677|gb|BM885933.1|BM885933
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|6725769|gb|AW310168.1|AW310168
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|5606061|gb|AI900159.1|AI900159
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|192330083|gb|FK020899.1|FK020899
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|23729429|gb|BU762800.1|BU762800
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|209710235|gb|BW658931.1|BW658931
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|6095186|gb|AW119853.1|AW119853
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|8404300|gb|BE059934.1|BE059934
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|7029926|gb|AW459709.1|AW459709
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|9204377|gb|BE330601.1|BE330601
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|15201820|gb|BI425076.1|BI425076
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|24206126|gb|BU965379.1|BU965379
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|7234136|gb|AW569476.1|AW569476
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|13788094|gb|BG650686.1|BG650686
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|10845617|gb|BF068696.1|BF068696
EST:     CATCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCTACTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|192315677|gb|FK011145.1|FK011145
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|10843484|gb|BF066782.1|BF066782
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|18735395|gb|BM528740.1|BM528740
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|16106216|gb|BI893956.1|BI893956
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|192330491|gb|FK021222.1|FK021222
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|31457887|gb|CD399915.1|CD399915
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|6567095|gb|AW234722.1|AW234722
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|192315678|gb|FK011146.1|FK011146
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|298168677|gb|HO009607.1|HO009607
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|31476232|gb|CD418260.1|CD418260
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|298191131|gb|HO038610.1|HO038610
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|7639381|gb|AW733705.1|AW733705
EST:     CAGCAACATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|208142956|gb|GD942422.1|GD942422
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|4396527|gb|AI495524.1|AI495524
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|15662172|gb|BI699543.1|BI699543
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|21285671|gb|BQ473542.1|BQ473542
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|31309051|gb|CD394254.1|CD394254
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|7286001|gb|AW598488.1|AW598488
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|151402923|gb|EV272736.1|EV272736
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|192318826|gb|FK011440.1|FK011440
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|298165423|gb|HO011472.1|HO011472
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|18692893|gb|BM521741.1|BM521741
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|16347631|gb|BI973226.1|BI973226
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|151412368|gb|EV282180.1|EV282180
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGAGGCACTGTACATTTTCGCATATCCAAGTCAA
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTT-CGCATATCCAAGTCAA
EST: gi|6915370|gb|AW396900.1|AW396900
EST:     TCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: TCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|21887359|gb|BQ740572.1|BQ740572
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|298167044|gb|HO010483.1|HO010483
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGTTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|22541284|gb|BU091127.1|BU091127
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|298170950|gb|HO015926.1|HO015926
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|31306332|gb|CD391535.1|CD391535
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|14990642|gb|BI316315.1|BI316315
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|192300035|gb|FG991853.1|FG991853
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|298185504|gb|HO030717.1|HO030717
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|192318825|gb|FK011439.1|FK011439
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|12688125|gb|BG154461.1|BG154461
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|209728753|gb|BW655433.1|BW655433
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|192330492|gb|FK021223.1|FK021223
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|38192672|gb|CF921878.1|CF921878
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|298169553|gb|HO020913.1|HO020913
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|298165134|gb|HO011183.1|HO011183
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAGAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|58018390|gb|CX705132.1|CX705132
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|193729136|gb|FK663368.1|FK663368
EST:     GCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATAT
genomic: GCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATAT
EST: gi|9204127|gb|BE330351.1|BE330351
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|298169605|gb|HO020965.1|HO020965
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|16282369|gb|BI944979.1|BI944979
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|298166225|gb|HO009196.1|HO009196
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|19270475|gb|BM886731.1|BM886731
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|7590615|gb|AW706363.1|AW706363
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|208305212|gb|GE102283.1|GE102283
EST:     CAGCGAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|298185551|gb|HO030764.1|HO030764
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|16347772|gb|BI973367.1|BI973367
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|298176850|gb|HO026857.1|HO026857
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|298175074|gb|HO018069.1|HO018069
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|31469618|gb|CD411646.1|CD411646
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|213607231|gb|DB965117.1|DB965117
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|6566246|gb|AW233927.1|AW233927
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGGTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|298170710|gb|HO015686.1|HO015686
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|298186622|gb|HO037255.1|HO037255
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|298172232|gb|HO021824.1|HO021824
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|192330082|gb|FK020898.1|FK020898
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|209728752|gb|BW655432.1|BW655432
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
EST: gi|193529319|gb|FK486456.1|FK486456
EST:     CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAA                         GTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT
genomic: CAGCAAAATTCATTCTTGATTTGCTCAAAAATGCTGAGAGCAATGCTGAAgtatgtctat ... ttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAAT


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ctatttcatgccaactgtttccaaattaatttaactgaaatttttttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAATCAAGCACAGAAGCAAAGACGCCGAACATACCGAGCCCATGGAAGAATCA
                            atttaac  putative branch site (score: 3)
                                        tttttttcttttc  putative PPT
                 tttccaaattaattta  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gtatgtctatatatacttttttttgcttttccatatggctatttcatgccaactgtttccaaattaatttaactgaaatttttttcttttcagGTGAAAGGTTTGGATGTTGATGCACTGTACATTTCGCATATCCAAGTCAATCAAGCACAGAAGCAAAGACGCCGAACATACCGAGCCCATGGAAGAATCA

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGAAGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AAGCAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GCAAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CATGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GGAAGA