Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtataccttcaatatactctttttattttcctagttacttcaccttaattattcatcattagctatgtacaatatgtatactaacaagctagctatgcctctaattttatgcagTTCTTGTCAATGAAGCTTGCTTCGGTGAATCCCATGTTTTATGACTTGGCAACGGATCTAGACACCCTCTTGGTTAGGCCAGAG

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA06G17420.1
intron # 4
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|298198903|gb|HO042266.1|HO042266
EST:     TGTTGGATGAAATAATCAATTATGTTCAGTCTTTACAGAATCAAGCTGAG                         TTCTTGTCAATGAAGCTTGCTTCGGTGAATCCCATGTTTTATGACTTGGCA
genomic: TGTTGGATGAAATAATCAATTATGTTCAGTCTTTACAGAATCAAGTTGAGgtataccttc ... ttttatgcagTTCTTGTCAATGAAGCTTGCTTCGGTGAATCCCATGTTTTATGACTTGGCA






















 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tagctatgtacaatatgtatactaacaagctagctatgcctctaattttatgcagTTCTTGTCAATGAAGCTTGCTTCGGTGAATCCCATGTTTTATGACTTGGCAACGGATCTAGACACCCTCTTGGTTAGGCCAGAG
           aatatgtatactaa  TA-rich tract