1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtaattttttttatttttttatttttagtcactactccctctttcaaattcaattggttatttttttgacactttggtttattgtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTGAGATATTCATGGGTGGAAAGAACACAATTGTGTTGCACAACACATGTG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA05G31450.4 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|193524006|gb|FK481051.1|FK481051
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTAEST: gi|193456225|gb|FK423041.1|FK423041
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTA
EST: CCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|208272715|gb|GE066221.1|GE066221
genomic: CCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGAEST: gi|22525838|gb|BU084649.1|BU084649
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGA
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|193531203|gb|FK486268.1|FK486268
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|22525230|gb|BU084041.1|BU084041
genomic: CCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATEST: gi|193637695|gb|FK583542.1|FK583542
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGAT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|10231931|gb|BE800819.1|BE800819
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|15285788|gb|BI469679.1|BI469679
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|27424631|gb|CA936151.1|CA936151
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|22931708|gb|BU548847.1|BU548847
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|7283317|gb|AW595925.1|AW595925
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|22933777|gb|BU550916.1|BU550916
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|193665341|gb|FK608011.1|FK608011
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: TCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|10231949|gb|BE800837.1|BE800837
genomic: TCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|192301389|gb|FG994713.1|FG994713
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTTTEST: gi|193677782|gb|FK614952.1|FK614952
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|15664440|gb|BI701811.1|BI701811
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|20448537|gb|BQ252661.1|BQ252661
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|10231153|gb|BE800100.1|BE800100
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|193485468|gb|FK452551.1|FK452551
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGEST: gi|9259990|gb|BE348137.1|BE348137
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAG
EST: CATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCAATTA-G TACCTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTTCACTTTEST: gi|192305229|gb|FG997523.1|FG997523
genomic: CATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCA-TTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTC
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTGGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGACGAGTACACTTCTEST: gi|5677640|gb|AI938770.1|AI938770
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|17021564|gb|BM092598.1|BM092598
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|208241625|gb|GE038285.1|GE038285
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|120492376|gb|EH220543.1|EH220543
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|10234429|gb|BE803317.1|BE803317
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGATTACACTTCTEST: gi|10253117|gb|BE820883.1|BE820883
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|9204546|gb|BE330770.1|BE330770
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTATGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|8669934|gb|BE191041.1|BE191041
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|6718757|gb|AW306404.1|AW306404
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|208317783|gb|GE114940.1|GE114940
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|12688968|gb|BG155304.1|BG155304
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|120529467|gb|EH257601.1|EH257601
genomic: CCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGTACATCCAGACCATGTGCTTGTCATTAAG TACGGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCEST: gi|208290678|gb|GE082350.1|GE082350
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTAC-GTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTC
EST: CCNTCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGAEST: gi|17964415|gb|BM271150.1|BM271150
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGA
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|120492865|gb|EH221032.1|EH221032
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|207788327|gb|GD762139.1|GD762139
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|193517282|gb|FK476505.1|FK476505
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|15285651|gb|BI469542.1|BI469542
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCTTCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|193404431|gb|FK365340.1|FK365340
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: GAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|193403549|gb|FK366919.1|FK366919
genomic: GAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGG-ACAGEST: gi|207771562|gb|GD742953.1|GD742953
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAG
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|193530412|gb|FK486611.1|FK486611
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|192301388|gb|FG994712.1|FG994712
genomic: CCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|20812941|gb|BQ297419.1|BQ297419
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|12688397|gb|BG154733.1|BG154733
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: TCCTCTATGAGNCCCGGTGAACATNCCAGACCATGTGGNTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|15287101|gb|BI470992.1|BI470992
genomic: TCCTCTATGAG-CCCGGTGAACAT-CCAGACCATGTGG-TTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|15200236|gb|BI424244.1|BI424244
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|120493361|gb|EH221528.1|EH221528
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|207783762|gb|GD756000.1|GD756000
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|9986213|gb|BE660321.1|BE660321
genomic: CCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|15203303|gb|BI426071.1|BI426071
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|193396085|gb|FK361840.1|FK361840
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGAEST: gi|9204909|gb|BE331133.1|BE331133
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGA
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|208216053|gb|GE008961.1|GE008961
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGAEST: gi|207692020|gb|GD673937.1|GD673937
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGA
EST: AACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTTAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|10232271|gb|BE801159.1|BE801159
genomic: AACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|208313222|gb|GE110920.1|GE110920
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|208247303|gb|GE048947.1|GE048947
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|22522672|gb|BU081483.1|BU081483
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|8670153|gb|BE191260.1|BE191260
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAGGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|10231165|gb|BE800112.1|BE800112
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|151406372|gb|EV276187.1|EV276187
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|13312611|gb|BG406262.1|BG406262
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|12688896|gb|BG155232.1|BG155232
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|192300396|gb|FG987883.1|FG987883
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|27425475|gb|CA936995.1|CA936995
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|14008873|gb|BG725477.1|BG725477
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|193319266|gb|FK285430.1|FK285430
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|15203180|gb|BI425948.1|BI425948
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|193710133|gb|FK642831.1|FK642831
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|120496079|gb|EH224246.1|EH224246
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGNTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|20498701|gb|BQ273631.1|BQ273631
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|6913694|gb|AW395224.1|AW395224
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATGCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|26269143|gb|CA820206.1|CA820206
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|207833383|gb|GD804514.1|GD804514
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGEST: gi|27425861|gb|CA937381.1|CA937381
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATG
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|120495212|gb|EH223379.1|EH223379
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTEST: gi|120495709|gb|EH223876.1|EH223876
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
EST: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAG TACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
genomic: CCATCCTCTATGAGCCCGGTGAACATCCAGACCATGTGGTTGTCATTAAGgtaatttttt ... gtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCT
ctctttcaaattcaattggttatttttttgacactttggtttattgtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTGAGATATTCATGGGTGGAAAGAACACAATTGTGTTGCACAACACATGTG
ttttgac putative branch site (score: 3)
ttgttttt putative PPT
aaattcaattggttat TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| gtaattttttttatttttttatttttagtcactactccctctttcaaattcaattggttatttttttgacactttggtttattgtttttgcagTACGTGCCTTATGTAGGGGACAGCAAGAGGGCCATGGATGAGTACACTTCTGAGATATTCATGGGTGGAAAGAACACAATTGTGTTGCACAACACATGTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAAGAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAC