Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   		22  
 5'  3'   		23  
 5'  3'   		24  
 5'  3'   		25  
 5'  3'   		26  
 5'  3'   		27  
 5'  3'   		28  
 5'  3'   		29  
 5'  3'   		30  
 5'  3'   		31  
 5'  3'   		32  
 5'  3'   		33  
 5'  3'   		34  
 5'  3'   		35  
 5'  3'   		36  
 5'  3'   		37  
 5'  3'   		38  
 5'  3'   		39  
 5'  3'   		40  
 5'  3'   
41  
 5'  3'   		42  
 5'  3'   		43  
 5'  3'   		44  
 5'  3'   		45  
 5'  3'   		46  
 5'  3'   		47  
 5'  3'   		48  
 5'  3'   		49  
 5'  3'   		50  
 5'  3'   		51  
 5'  3'   		52  
 5'  3'   		53  
 5'  3'   		54  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtgttgttcttttaaccttctgaattacatccttttgaagtgttgagtgcactagaacttatacaacctactattgcacatttcagGCACTCCCATCCATTGCTAAGGAAGTTATAGAAGTTTTGGACATTCTTCTGAGGTGGTTTGTGTTGCAGTTCTGCAAATCAAACACAACATGTCTATTGA

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G35140.1
intron # 36
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|192331654|gb|FK019987.1|FK019987
EST:     TAAGTGCAGATTTTAAGAAGCAAGTTGATGGACTTGAAATGCTGCAGAAG                         GCACTCCCATCCATTGCTAAGGAAGTTATAGAAGTTTTGGACATTCTTCTG
genomic: TAAGTGCAGATTTTAAGAAGCAAGTTGATGGACTTGAAATGCTGCAGAAGgtgttgttct ... cacatttcagGCACTCCCATCCATTGCTAAGGAAGTTATAGAAGTTTTGGACATTCTTCTG






















 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

cttttgaagtgttgagtgcactagaacttatacaacctactattgcacatttcagGCACTCCCATCCATTGCTAAGGAAGTTATAGAAGTTTTGGACATTCTTCTGAGGTGGTTTGTGTTGCAGTTCTGCAAATCAAACACAACATGTCTATTGA
                        aacttata  TA-rich tract