1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
...ctaaccctctgtattgatgtccttttttccccctttccatgaatgcaattcttgtgtgggtttgtagtgacattgcagactgttgaactttctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGCGAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA20G21190.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|20498169|gb|BQ273099.1|BQ273099
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|58018699|gb|CX705441.1|CX705441
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|151394186|gb|EV264057.1|EV264057
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCCATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|21678027|gb|BQ630378.1|BQ630378
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|24205643|gb|BU964896.1|BU964896
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|192316858|gb|FK006085.1|FK006085
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|10845025|gb|BF068214.1|BF068214
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGCTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|17023989|gb|BM095023.1|BM095023
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|254316297|gb|GR827834.1|GR827834
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|22541845|gb|BU091688.1|BU091688
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|298189761|gb|HO038164.1|HO038164
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|192325123|gb|FK019069.1|FK019069
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|48575088|gb|CO036228.1|CO036228
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTTCGCTACAAGCTCCTTGGTGGACTCGCTGTGCGCAG GGCCTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|37996532|gb|CF808121.1|CF808121
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|7041963|gb|AW471857.1|AW471857
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTACCTGTGCGCAC GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|192324902|gb|FK015383.1|FK015383
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|209701755|gb|BW655896.1|BW655896
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|209718519|gb|BW674683.1|BW674683
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|213603394|gb|DB966569.1|DB966569
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|58024786|gb|CX711527.1|CX711527
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|31307494|gb|CD392697.1|CD392697
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|13481301|gb|BG510644.1|BG510644
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|7925503|gb|AW831529.1|AW831529
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|26268284|gb|CA819347.1|CA819347
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|57576092|gb|CX549063.1|CX549063
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|9901298|gb|BE610266.1|BE610266
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTCGTTATGGAGAGTGGCGCTAAGGGATGEST: gi|298174155|gb|HO017491.1|HO017491
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|18040358|gb|BM308652.1|BM308652
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|13240447|gb|BG359756.1|BG359756
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|192326793|gb|FK017360.1|FK017360
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|8404055|gb|BE059689.1|BE059689
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|13790896|gb|BG653487.1|BG653487
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|9986821|gb|BE660929.1|BE660929
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|209701714|gb|BW655895.1|BW655895
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|209721034|gb|BW666291.1|BW666291
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: TGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|192316859|gb|FK006086.1|FK006086
genomic: TGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|19934412|gb|BQ079442.1|BQ079442
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|18040338|gb|BM308632.1|BM308632
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|22524443|gb|BU083254.1|BU083254
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGTTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|18040077|gb|BM308371.1|BM308371
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|192303477|gb|FG994483.1|FG994483
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|4292317|gb|AI437745.1|AI437745
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAANGGATGEST: gi|6915481|gb|AW397011.1|AW397011
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|15663235|gb|BI700606.1|BI700606
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|15664562|gb|BI701933.1|BI701933
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|21600670|gb|BQ611001.1|BQ611001
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|23727936|gb|BU762008.1|BU762008
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|254316296|gb|GR827833.1|GR827833
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|192315548|gb|FK009700.1|FK009700
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|9820315|gb|BE555825.1|BE555825
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAAAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|192303478|gb|FG994484.1|FG994484
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: GTCTTTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGTTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|192315549|gb|FK009701.1|FK009701
genomic: GTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|209721033|gb|BW666290.1|BW666290
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTTTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGEST: gi|13562761|gb|BG550981.1|BG550981
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
EST: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAG GGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGNGCTTAGGGATG
genomic: CAGGCTGAGTCTCTCCGCTACAAGCTCCTTGGTGGCCTAGCTGTGCGCAGgtatatgcat ... tctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATG
caattcttgtgtgggtttgtagtgacattgcagactgttgaactttctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGCGAG
ctttctgtttc CT-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ctaaccctctgtattgatgtccttttttccccctttccatgaatgcaattcttgtgtgggtttgtagtgacattgcagactgttgaactttctgtttcagGGCTTGCTATGGTGTCTTGAGGTTTGTTATGGAGAGTGGTGCTAAGGGATGCGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGA
ctaaccc
- - - - - - - tgatgtc
- - - - - - - - - - - - - ttccccc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gaatgca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gggtttg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tgcagac
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tgttgaa