1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
...tctttgtttgttctaaagtttttggtgtttatcaccaatcattaactgtacaccatcttgagttttagctttgattatagcctttcttgtttcttaccagCAATGCAGAGAAGGCCAGGATGTCCTCCCTGAGCAAATTAAAGCGGTGCTCTCGGATTCTGCTGGCTTCCATGGTATGATGTGATTGGAATGCTTGATAA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA19G27480.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTGTTATTAGCTGTTTTAATGGCTTTGCTTTAGATGTGTTCAAAGCTGAG CAATGCAGAGAAGGCCAGGATGTCCTCCCTGAGCAAATTAAAGCGGTGCTCEST: gi|6726524|gb|AW310878.1|AW310878
genomic: CTGTTATTAGCTGTTTTAATGGCTTTGCTTTAGATGTGTTCAAAGCTGAGgtataattct ... ttcttaccagCAATGCAGAGAAGGCCAGGATGTCCTCCCTGAGCAAATTAAAGCGGTGCTC
EST: CTGTTATTAGCTGTTTTAATGGCTTTGCTTTAGATGTGTTCAAAGCTGAG CAATGCAGAGAAGGCCAGGATGTCCTCCCTGAGCAAATTAAAGCGGTGCTCEST: gi|298178876|gb|HO024611.1|HO024611
genomic: CTGTTATTAGCTGTTTTAATGGCTTTGCTTTAGATGTGTTCAAAGCTGAGgtataattct ... ttcttaccagCAATGCAGAGAAGGCCAGGATGTCCTCCCTGAGCAAATTAAAGCGGTGCTC
EST: CTGTTATTAGCTGTTTTAATGGCTTTGCTTTAGATGTGTTCAAAGCTGAG CAATGCAGAGAAGGCCAGGATGTCCTCCCTGAGCAAAT
genomic: CTGTTATTAGCTGTTTTAATGGCTTTGCTTTAGATGTGTTCAAAGCTGAGgtataattct ... ttcttaccagCAATGCAGAGAAGGCCAGGATGTCCTCCCTGAGCAAAT
ctgtacaccatcttgagttttagctttgattatagcctttcttgtttcttaccagCAATGCAGAGAAGGCCAGGATGTCCTCCCTGAGCAAATTAAAGCGGTGCTCTCGGATTCTGCTGGCTTCCATGGTATGATGTGATTGGAATGCTTGATAA
ctttgat putative branch site (score: 5)
cctttcttgtttctta putative PPT
tttgattata TA-rich tract