1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
...tttaaaccatatttcacattaaggttatattagtatctataatttaataataattaacgccttaaattcttaatgctttcaattaatttttcatgggcagGATTCGTCGTGGTCATCAAGTTTATACAGAAGTCTGTGCTTCCTGCCATTCTATGTCTTTGATATCGTATCGTGATTTGGTTGGTGTTGCTTATACAGAA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA19G24620.2 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AGCTATCCGTGGCCTCACAAAGGAATTCTTAGTTCATATGATCATGCTTC GATTCGTCGTGGTCATCAAGTTTATACAGAAGTCTGTGCTTCCTGCCATTCEST: gi|192326431|gb|FK017703.1|FK017703
genomic: AGCTATCCGTGGCCTCACAAAGGAATTCTTAGTTCATATGATCATGCTTCgtaagtttgg ... tcatgggcagGATTCGTCGTGGTCATCAAGTTTATACAGAAGTCTGTGCTTCCTGCCATTC
EST: AGCTATCCGTGGCCTCACAAAGGAATTCTTAGTTCATATGATCATGCTTC GATTCGTCGTGGTCATCAAGTTTATACAGAAGTCTGTGCTTCCTGCCATTCEST: gi|254330991|gb|GR842256.1|GR842256
genomic: AGCTATCCGTGGCCTCACAAAGGAATTCTTAGTTCATATGATCATGCTTCgtaagtttgg ... tcatgggcagGATTCGTCGTGGTCATCAAGTTTATACAGAAGTCTGTGCTTCCTGCCATTC
EST: AGCTATCCATGGCCTCACAAGGGAATTCTTAGTTCATATGATCACGCTTC GATTCGTCGTGGTCATCAAGTTTATACAGAAGTCTGTGCTTCCTGCCATTC
genomic: AGCTATCCGTGGCCTCACAAAGGAATTCTTAGTTCATATGATCATGCTTCgtaagtttgg ... tcatgggcagGATTCGTCGTGGTCATCAAGTTTATACAGAAGTCTGTGCTTCCTGCCATTC
aataataattaacgccttaaattcttaatgctttcaattaatttttcatgggcagGATTCGTCGTGGTCATCAAGTTTATACAGAAGTCTGTGCTTCCTGCCATTCTATGTCTTTGATATCGTATCGTGATTTGGTTGGTGTTGCTTATACAGAA
tttttcat CT-rich tract
ttaaattcttaatgct TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| tttaaaccatatttcacattaaggttatattagtatctataatttaataataattaacgccttaaattcttaatgctttcaattaatttttcatgggcagGATTCGTCGTGGTCATCAAGTTTATACAGAAGTCTGTGCTTCCTGCCATTCTATGTCTTTGATATCGTATCGTGATTTGGTTGGTGTTGCTTATACAGAA
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