1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtttgtgatatcaattctttttcatcaaaattcccttcacctttgaatctctcgatactcattctgtttttcttcttccatttgatttgccacagGATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCGCATTG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA17G00250.2 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGG GATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCGEST: gi|151409763|gb|EV279571.1|EV279571
genomic: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGGgtttgtgata ... tttgccacagGATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCG
EST: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGG GATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCGEST: gi|192326423|gb|FK015925.1|FK015925
genomic: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGGgtttgtgata ... tttgccacagGATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCG
EST: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGG GATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCGEST: gi|298194297|gb|HO040945.1|HO040945
genomic: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGGgtttgtgata ... tttgccacagGATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCG
EST: GAAGAAGGTCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGG GATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCEST: gi|298166707|gb|HO010146.1|HO010146
genomic: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGGgtttgtgata ... tttgccacagGATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCC
EST: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATCTTAATGG GATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCGEST: gi|58022692|gb|CX709433.1|CX709433
genomic: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGGgtttgtgata ... tttgccacagGATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCG
EST: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGG GATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCGEST: gi|4396313|gb|AI495310.1|AI495310
genomic: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGGgtttgtgata ... tttgccacagGATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCG
EST: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGG GATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCGEST: gi|254326666|gb|GR832818.1|GR832818
genomic: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGGgtttgtgata ... tttgccacagGATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCG
EST: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGG GATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCGEST: gi|298178229|gb|HO023964.1|HO023964
genomic: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGGgtttgtgata ... tttgccacagGATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCG
EST: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGG GATCATTTCAGTTATGGACCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCGEST: gi|7795909|gb|AW781306.1|AW781306
genomic: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGGgtttgtgata ... tttgccacagGATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCG
EST: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGG GATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCGEST: gi|298184274|gb|HO029487.1|HO029487
genomic: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGGgtttgtgata ... tttgccacagGATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCG
EST: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGG GATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCG
genomic: GAAGAAGATCACGAGCGTGTTGTTGATTGCACTACTCCCAATTTTAATGGgtttgtgata ... tttgccacagGATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCG
ctttgaatctctcgatactcattctgtttttcttcttccatttgatttgccacagGATCATTTCAGTTATGGATCCAAATCGGAGTTGGGCTGCCCGTTGGTTGCGCATTG
atttgat putative branch site (score: 5)
ttctgtttttcttctt CT-rich tract
atttgattt TA-rich tract