Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtatgcctaacactcccaatttagatatctatgtatgtgttatgttacattagttgtattctaatgttggtttgattggttgatgctctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGCTGGATTCATCATTCCCGAGGCCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGT

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA16G33030.1
intron # 3
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA16G33030.1 (Glycine max), 3'ss of exon 3
lower sequence: LOC_Os11g13890.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 3
gtatgcctaaca-ctcccaatttagatatctatgtatgtgttatgttacattagttgtattctaatgtt--ggtttgattggttgatgctctaa---tgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGCTGGATTCATCATTCCCGAGGCCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGT
   |   || || |   ||||    | ||   | |   | | |   |  | |  |   |||||  | |    ||   ||  |   |   | | |   ||||| || ||||| | |||  |||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| 
--gtaagtagcagcgttcaatcctcaaattcttcttcttttcagactcaaattttcagattcttgtatctgagtaaaatctgacaaaattttcaccctgcagGTACCAGGCCTATGAGCTGATCCATGCCAGGTGGGCGATGCTCGGCGCCGCTGGGTTCATCATCCCCGAGGCCTGCAACAAGTTTGGCGCAAACTGCGGC

upper sequence: GLYMA16G33030.1 (Glycine max), 3'ss of exon 3
lower sequence: AT4G10340.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 3
gtatgcctaacactcccaatttagatatct-atgtatgtgttatgttacattagttgtattctaatgttggtttgattggttgatg--ctctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGCTGGATTCATCATTCCCGAGGCCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGT
||| |    |  ||   |   || |  | |  ||| ||  ||  | || ||   | | |||      |  | ||| ||  || |||        || ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||| | || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || 
gtaagta-gattcttttatcctaaaccttttgtgtttgctttgagctatatctatcgaatttgtcattaagattggttctttaatgaatgtggttgtagATACCAAGCTTTTGAATTGATCCATGCGAGATGGGCTATGTTAGGAGCAGCTGGTTTCATCATTCCTGAAGCTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGC

upper sequence: GLYMA16G33030.1 (Glycine max), 3'ss of exon 3
lower sequence: Vv18s0089g01170.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 4
-------------------------------gtatgcctaacactccca--atttagatatctatgtatgtgttatgttacattagttgtattctaatgttggtttga--ttggttgatgctctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGCTGGATTCATCATTCCCGAGGCCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGT
                                | |||||   |||   |  |  |   ||      | | |   |      ||  ||| ||| | | || ||    ||  || ||    | | |  ||||||||||| |||| |||| |||| |||||| | ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || || |||||||| 
gtaagtgaaactgttggttgattcttcctttttttgccttgaactgtaatgagatttgtactggattgtctagaaaaagggatctgttttatgccactgatgaagagaaattcgtgaggggtttgttgcagATATCAAGCATATGAACTGATCCACGCCCGGTGGGCTATGCTCGGCGCAGCTGGCTTCATCATCCCTGAGGCCTTCAACAAATTCGGTGCCAACTGCGGC

upper sequence: GLYMA16G33030.1 (Glycine max), 3'ss of exon 3
lower sequence: EFJ11555 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 3
gtatgcctaacactcccaatttagatatctatgtatgtgttatgttacattagttgtattctaatgttggtttgattggttgatgctctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGCTGGATTCATCATTCCCGAGGCCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGT
                                ||| |    ||   |    | | ||    |  |     || ||||| |   |  |||  |  |||||||| || |  ||| | ||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |||||||| | ||||||| | || || 
--------------------------------gtaagaaacat-ccatgcaaatcgttccttctt-----ttcgattgatcttttttct--tctagATATCAAGCCTACGAACTCATTCACGCTCGATGGGCGATGCTCGGCGCTGCTGGATTTGTTATTCCCGAGGCTTTCAACAAGTTTGGAGCACAGTGTGGC

upper sequence: GLYMA16G33030.1 (Glycine max), 3'ss of exon 3
lower sequence: EFJ18942 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 3
gtatgcctaacactcccaatttagatatctatgtatgtgttatgttacattagttgtattctaatgttggtttgattggttgatgctctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGCTGGATTCATCATTCCCGAGGCCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGT
                                ||| |    ||   |    | | ||    |  |     || ||||| |   || |||  |  |||||||| || |  ||| | || |||||  ||||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |||||||| | ||||||| | || || 
--------------------------------gtaagaaacat-ccatgcaaatcgttccttctt-----ttcgattgatctttgttct--tctagATATCAAGCCTACGAACTCATCCACGCTCGATGGGCGATGCTCGGCGCTGCTGGATTTGTTATTCCCGAGGCTTTCAACAAGTTTGGAGCACAGTGTGGC

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|20497947|gb|BQ272877.1|BQ272877
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|23063929|gb|BU578703.1|BU578703
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|4313797|gb|AI460916.1|AI460916
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|7145720|gb|AW507642.1|AW507642
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|4396584|gb|AI495581.1|AI495581
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTNTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATG
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATG
EST: gi|8670480|gb|BE191587.1|BE191587
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|209725349|gb|BW658247.1|BW658247
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|209721017|gb|BW682496.1|BW682496
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|15285587|gb|BI469478.1|BI469478
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|20448919|gb|BQ253043.1|BQ253043
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATG
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATG
EST: gi|31459175|gb|CD401203.1|CD401203
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|31470063|gb|CD412091.1|CD412091
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|9899088|gb|BE608056.1|BE608056
EST:     TATGGTTATGACCCATTGGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGA-TTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|6134573|gb|AW132966.1|AW132966
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|7233865|gb|AW569208.1|AW569208
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|209716659|gb|BW682220.1|BW682220
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|20448722|gb|BQ252846.1|BQ252846
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|120530661|gb|EH258794.1|EH258794
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|26057166|gb|CA800080.1|CA800080
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|21676857|gb|BQ629208.1|BQ629208
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|192309277|gb|FG999476.1|FG999476
EST:     TATGGTTATGACCCATCTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|23058509|gb|BU578319.1|BU578319
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|209710533|gb|BW662069.1|BW662069
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|213593074|gb|DB969872.1|DB969872
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|31561938|gb|CD487776.1|CD487776
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|20448780|gb|BQ252904.1|BQ252904
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|22523574|gb|BU082385.1|BU082385
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|27424688|gb|CA936208.1|CA936208
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|8669102|gb|BE190204.1|BE190204
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|209706244|gb|BW680659.1|BW680659
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|209698465|gb|BW667262.1|BW667262
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|31307545|gb|CD392748.1|CD392748
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|5753301|gb|AI960588.1|AI960588
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|4313803|gb|AI460922.1|AI460922
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|209720872|gb|BW662598.1|BW662598
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|9203469|gb|BE329693.1|BE329693
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|151412521|gb|EV282333.1|EV282333
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATCTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|31461523|gb|CD403551.1|CD403551
EST:     GATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: GATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|7232430|gb|AW567786.1|AW567786
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|5606615|gb|AI900713.1|AI900713
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|19936492|gb|BQ080889.1|BQ080889
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|19453008|gb|BM954418.1|BM954418
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|7283534|gb|AW596140.1|AW596140
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|6071769|gb|AW101156.1|AW101156
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|20076089|gb|BQ094872.1|BQ094872
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|31463834|gb|CD405862.1|CD405862
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAC                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|15337851|gb|BI498507.1|BI498507
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|8826408|gb|BE210138.1|BE210138
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|10843736|gb|BF067207.1|BF067207
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|13479687|gb|BG509030.1|BG509030
EST:     GCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: GCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|15200139|gb|BI424193.1|BI424193
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|9259814|gb|BE347961.1|BE347961
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|5688183|gb|AI941198.1|AI941198
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|209718591|gb|BW662696.1|BW662696
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|10843127|gb|BF067157.1|BF067157
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|209720873|gb|BW662599.1|BW662599
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGACCTCCCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|23728211|gb|BU762151.1|BU762151
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|213591516|gb|DB959946.1|DB959946
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCGAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|13788147|gb|BG650739.1|BG650739
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|23050476|gb|BU577005.1|BU577005
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|26268091|gb|CA819154.1|CA819154
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|10235177|gb|BE804065.1|BE804065
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|9902318|gb|BE611286.1|BE611286
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|6134032|gb|AW132482.1|AW132482
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|213607347|gb|DB957155.1|DB957155
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|120534112|gb|EH262245.1|EH262245
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|26057356|gb|CA800270.1|CA800270
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|31458586|gb|CD400614.1|CD400614
EST:     AGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: AGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|213594884|gb|DB971771.1|DB971771
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|120531346|gb|EH259479.1|EH259479
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|15200628|gb|BI424446.1|BI424446
EST:     GAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: GAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|213591356|gb|DB973817.1|DB973817
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|209722542|gb|BW682640.1|BW682640
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|7326544|gb|AW620342.1|AW620342
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCACATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|213610458|gb|DB958777.1|DB958777
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|209705308|gb|BW667979.1|BW667979
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|6134010|gb|AW132460.1|AW132460
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|5342654|gb|AI794938.1|AI794938
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCACGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|6134970|gb|AW133363.1|AW133363
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|10235347|gb|BE804235.1|BE804235
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCACGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|192309278|gb|FG999477.1|FG999477
EST:     TATGGTTATGACCCATCTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|298193915|gb|HO040563.1|HO040563
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|7685853|gb|AW756501.1|AW756501
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|120530617|gb|EH258750.1|EH258750
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|9205216|gb|BE331440.1|BE331440
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|105633937|gb|DW247300.1|DW247300
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|7326896|gb|AW620694.1|AW620694
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|15285047|gb|BI468938.1|BI468938
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|209725348|gb|BW658246.1|BW658246
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|20813024|gb|BQ297502.1|BQ297502
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|213596464|gb|DB960281.1|DB960281
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|5509200|gb|AI855758.1|AI855758
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|5677808|gb|AI938938.1|AI938938
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|15204669|gb|BI427437.1|BI427437
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|15285094|gb|BI468985.1|BI468985
EST:     TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: TATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
EST: gi|5606982|gb|AI901080.1|AI901080
EST:     ATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAA                         ATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC
genomic: ATGGTTATGACCCATTTGGTCTTAGCAAGAAGCCAGAAGATTTTTCCAAgtatgcctaa ... tctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGC


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

atgttacattagttgtattctaatgttggtttgattggttgatgctctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGCTGGATTCATCATTCCCGAGGCCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGT
               tattctaat  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gtatgcctaacactcccaatttagatatctatgtatgtgttatgttacattagttgtattctaatgttggtttgattggttgatgctctaatgcagATATCAGGCATTTGAATTGATTCACGCCAGATGGGCAATGCTTGGTGCTGCTGGATTCATCATTCCCGAGGCCTTCAACAAATATGGAGCAAACTGCGGT

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GGAGCA