1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gtgtgtatggcagaatgaaattcgttttctttatagagttttctctttggaaattggaaaattgtgtctgactactatgttctgcaacagCTGCTGCGGCTTGTCTTTGTGTTCAAGTGAAGGGAGCCTCTCCTAGCATGCCTGATAGGAAATCTGTTTTGGATCTTCTTATTTGTCAATGAGAATACTC
species | Glycine max |
transcript | GLYMA13G33840.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TGTGGCCTTGGTTGAGGGCAAGTCCAAAAAGGAATGCCTCAGATTTGCTG CTGCTGCGGCTTGTCTTTGTGTTCAAGTGAAGGGAGCCTCTCCTAGCATGCEST: gi|16279653|gb|BI943547.1|BI943547
genomic: TGTGGCCTTGGTTGAGGGCAAGTCCAAAAAGGAATGCCTCAGATTTGCTGgtgtgtatgg ... tctgcaacagCTGCTGCGGCTTGTCTTTGTGTTCAAGTGAAGGGAGCCTCTCCTAGCATGC
EST: TGTGGCCTTGGTTGAGGGCAAGTCCANAAAGGAATGCCTCAGATNTGCTG CTGCTGCGGCTTGTCTTTGTGTTCAAATGAAGGGAGCCTCTCCTAGCATGCEST: gi|254334364|gb|GR844149.1|GR844149
genomic: TGTGGCCTTGGTTGAGGGCAAGTCCAAAAAGGAATGCCTCAGATTTGCTGgtgtgtatgg ... tctgcaacagCTGCTGCGGCTTGTCTTTGTGTTCAAGTGAAGGGAGCCTCTCCTAGCATGC
EST: TGTGGCCTTGGTTGAGGGCAAGTCCAAAAAGGAATGCCTCAGATTTGCTG CTGCTGCGGCTTGTCTTTGTGTTCAAGTGAAGGGAGCCTCTCCTAGCATGCEST: gi|15813964|gb|BI786239.1|BI786239
genomic: TGTGGCCTTGGTTGAGGGCAAGTCCAAAAAGGAATGCCTCAGATTTGCTGgtgtgtatgg ... tctgcaacagCTGCTGCGGCTTGTCTTTGTGTTCAAGTGAAGGGAGCCTCTCCTAGCATGC
EST: TGTGGCCTTGGTTGAGGGCAAGTCCAAAAAGGAATGCCTCAGATTTGCTG CTGCTGCGGCTTGTCTTTGTGTTCAAGTGAAGGGAGCCTCTCCTAGCATGC
genomic: TGTGGCCTTGGTTGAGGGCAAGTCCAAAAAGGAATGCCTCAGATTTGCTGgtgtgtatgg ... tctgcaacagCTGCTGCGGCTTGTCTTTGTGTTCAAGTGAAGGGAGCCTCTCCTAGCATGC
gagttttctctttggaaattggaaaattgtgtctgactactatgttctgcaacagCTGCTGCGGCTTGTCTTTGTGTTCAAGTGAAGGGAGCCTCTCCTAGCATGCCTGATAGGAAATCTGTTTTGGATCTTCTTATTTGTCAATGAGAATACTC
gtctgac putative branch site (score: 3)
aaaattgt TA-rich tract