1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gtgagttagagcaccactgaaatttgaaaccaatttccagtgtatatgtttttattcttttcattgatgagatttttatgggacaagaacatcctggtaattgttttctcttgcagTGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTGATGATTCTATATTTTCTGAATCTGATAATAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA11G04420.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTG TGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTGEST: gi|12773182|gb|BG238109.1|BG238109
genomic: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTGgtgagttaga ... tctcttgcagTGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTG
EST: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTG TGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTGEST: gi|298183465|gb|HO028678.1|HO028678
genomic: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTGgtgagttaga ... tctcttgcagTGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTG
EST: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTG TGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTGEST: gi|31306393|gb|CD391596.1|CD391596
genomic: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTGgtgagttaga ... tctcttgcagTGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTG
EST: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTG TGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTGEST: gi|192298731|gb|FG990997.1|FG990997
genomic: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTGgtgagttaga ... tctcttgcagTGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTG
EST: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTG TGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTGEST: gi|192312780|gb|FK003992.1|FK003992
genomic: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTGgtgagttaga ... tctcttgcagTGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTG
EST: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTG TGTTAACGTATGAGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTGEST: gi|298197449|gb|HO044928.1|HO044928
genomic: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTGgtgagttaga ... tctcttgcagTGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTG
EST: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTG TGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTGEST: gi|192295310|gb|FG985964.1|FG985964
genomic: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTGgtgagttaga ... tctcttgcagTGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTG
EST: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTG TGTTAACGTATGTGCTCCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTGEST: gi|192312779|gb|FK003991.1|FK003991
genomic: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTGgtgagttaga ... tctcttgcagTGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTG
EST: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTG TGTTAACGTATGAGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTGEST: gi|192332695|gb|FK025352.1|FK025352
genomic: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTGgtgagttaga ... tctcttgcagTGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTG
EST: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTG TGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTGEST: gi|254318802|gb|GR830366.1|GR830366
genomic: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTGgtgagttaga ... tctcttgcagTGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTG
EST: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTG TGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTGEST: gi|298196857|gb|HO041600.1|HO041600
genomic: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTGgtgagttaga ... tctcttgcagTGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTG
EST: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTG TGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTGEST: gi|298180781|gb|HO022220.1|HO022220
genomic: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTGgtgagttaga ... tctcttgcagTGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTG
EST: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTG TGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTGEST: gi|10848287|gb|BF071708.1|BF071708
genomic: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTGgtgagttaga ... tctcttgcagTGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTG
EST: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTG TGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTG
genomic: GCATGTGCCTTGTATAATAACTGGTGGCCGATGCTGAGTGgtgagttaga ... tctcttgcagTGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTG
cattgatgagatttttatgggacaagaacatcctggtaattgttttctcttgcagTGTTAACGTATGTGCTTCTTCCAATGCCTTTGCTGTTCTTTGCGGGGTCTGATGATTCTATATTTTCTGAATCTGATAATAG
cattgat putative branch site (score: 4)
ttgttttctcttgc putative PPT
agatttttat TA-rich tract