Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...gaaggttgcttggaaatttatgagaatgtaaatatactattagtctattatatacagtcatggcatattccttatttgacaaattctattttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGATTACATCTGGATTACAAATGGATCACACAACACTGTTAATATAGCCTCC

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA08G40200.2
intron # 3
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|298183625|gb|HO028838.1|HO028838
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAAAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|213601870|gb|DB980222.1|DB980222
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|13790566|gb|BG653157.1|BG653157
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|298198974|gb|HO042337.1|HO042337
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|208317217|gb|GE111896.1|GE111896
EST:     GCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: GCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|209726748|gb|BW672475.1|BW672475
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|120496264|gb|EH224431.1|EH224431
EST:     CTATTGC--AAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|7234170|gb|AW569510.1|AW569510
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|7686032|gb|AW756680.1|AW756680
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|192303194|gb|FG997770.1|FG997770
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|13563498|gb|BG551718.1|BG551718
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|9259379|gb|BE347526.1|BE347526
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|193628535|gb|FK575847.1|FK575847
EST:     TTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: TTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|20449451|gb|BQ253575.1|BQ253575
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|6746775|gb|AW317231.1|AW317231
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAC                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|120529548|gb|EH257682.1|EH257682
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|298176597|gb|HO023184.1|HO023184
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|120496411|gb|EH224578.1|EH224578
EST:     CTATTGC--AAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|120533322|gb|EH261455.1|EH261455
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|120529853|gb|EH257987.1|EH257987
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|7326786|gb|AW620584.1|AW620584
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|192315587|gb|FK007415.1|FK007415
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|27423463|gb|CA934983.1|CA934983
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|13252780|gb|BG363683.1|BG363683
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|208297831|gb|GE090974.1|GE090974
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAA
EST: gi|58018107|gb|CX704849.1|CX704849
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|208286390|gb|GE087806.1|GE087806
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAG
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAG
EST: gi|15816158|gb|BI788433.1|BI788433
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|209707431|gb|BW670672.1|BW670672
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|58018538|gb|CX705280.1|CX705280
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|208250807|gb|GE043798.1|GE043798
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGA
EST: gi|209726747|gb|BW672474.1|BW672474
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|298185073|gb|HO030286.1|HO030286
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|16348314|gb|BI973909.1|BI973909
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|6482125|gb|AW201396.1|AW201396
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|298186827|gb|HO033926.1|HO033926
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|151409099|gb|EV278907.1|EV278907
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|209703683|gb|BW670673.1|BW670673
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|213595698|gb|DB962470.1|DB962470
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|58024844|gb|CX711585.1|CX711585
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|151399159|gb|EV269030.1|EV269030
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGCTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|151395682|gb|EV265559.1|EV265559
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|14196138|gb|BE820012.2|BE820012
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|18039091|gb|BM307385.1|BM307385
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|7686191|gb|AW756839.1|AW756839
EST:     CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
EST: gi|38192832|gb|CF922038.1|CF922038
EST:     CTATTACTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAG                         AAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA
genomic: CTATTGCTGAAAATGAATCTATTGGAAGAGAACGCTACAGCTTTATGCAGgttcattttt ... ttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGA


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tattatatacagtcatggcatattccttatttgacaaattctattttttgtgcagAAAATGCTCCTGCCTTGTGGTTTGCCTCCCGAAAGAGAAGAAGATTAAGGATTACATCTGGATTACAAATGGATCACACAACACTGTTAATATAGCCTCC
                            atttgac  putative branch site (score: 4)
                                      ttctatttttt  putative PPT
                          ttatttgacaaattct  TA-rich tract