1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtgtgccttataaacttctctatttggttttgttttgttttggcattcctgacacctccttttttattgctggatttactctttattcattgtcattttctcttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCACAACTTCCAGAAGGTGGTGTTTTGCTTCTAGAGAATGTGAGGTTCTATA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA08G17600.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|207776090|gb|GD747731.1|GD747731
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: CCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|207754681|gb|GD729304.1|GD729304
genomic: CCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: CAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|209714549|gb|BW662212.1|BW662212
genomic: CAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|298198247|gb|HO039786.1|HO039786
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCACAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|193365334|gb|FK332723.1|FK332723
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: TGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|24206138|gb|BU965391.1|BU965391
genomic: TGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|208209100|gb|GE003090.1|GE003090
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|213610576|gb|DB960615.1|DB960615
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|213590392|gb|DB971540.1|DB971540
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|5606888|gb|AI900986.1|AI900986
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|8402320|gb|BE057954.1|BE057954
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|213589598|gb|DB965814.1|DB965814
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|298165436|gb|HO011485.1|HO011485
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: ACAGTTTGAAGCCTTTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|151412432|gb|EV282244.1|EV282244
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|192295471|gb|FG987085.1|FG987085
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|213608836|gb|DB957200.1|DB957200
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|213610262|gb|DB962932.1|DB962932
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|209721583|gb|BW671724.1|BW671724
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|21600463|gb|BQ610794.1|BQ610794
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|16347493|gb|BI973088.1|BI973088
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGNGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|254341877|gb|GR853014.1|GR853014
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|298188541|gb|HO035234.1|HO035234
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCAEST: gi|15661932|gb|BI699303.1|BI699303
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
EST: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAG GTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
genomic: ACAGTTTGAAGCCTCTTGTGCCAAGGCTGTCTCAACTTCTCGGAATTGAGgtgtgcctta ... cttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCA
tccttttttattgctggatttactctttattcattgtcattttctcttgatatagGTTACGATGGCAAATGACTCTATTGGGGAGGAAGTTGAGAAGTTGGTTGCACAACTTCCAGAAGGTGGTGTTTTGCTTCTAGAGAATGTGAGGTTCTATA
tcttgat putative branch site (score: 4)
ttgtcattttctctt CT-rich tract
atttactctttatt TA-rich tract