1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
gtatgtttgtgtgttggtgttactcgtttattttaacggaaggtttcttttggtttagatgttagatgtcttaattaattgttttgcttgtgggttggtgcagGTTCATAAGGTGCCCGCAAATGACATGGAGGCCTTGAAGTCTCCACTTATGGGGCTATTTGAAAAACGCCGAGCACGCAAGTTTTTCATTTATGTGCAAA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA08G13300.2 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TGTGTTTAATAAAGGAAAG GTTCATAAGGTGCCCGCAAATGACATGGAGGCCTTGAAGTCTCCACTTATGEST: gi|208192944|gb|GD987951.1|GD987951
genomic: TGTGTTTAATAAAGGAAAGgtatgtttgt ... gttggtgcagGTTCATAAGGTGCCCGCAAATGACATGGAGGCCTTGAAGTCTCCACTTATG
EST: TTTAATAAAGGAAAG GTTCATAAGGTGCCCGCAAATGACATGGAGGCCTTGAAGTCTCCACTTATGEST: gi|192326977|gb|FK019239.1|FK019239
genomic: TTTAATAAAGGAAAGgtatgtttgt ... gttggtgcagGTTCATAAGGTGCCCGCAAATGACATGGAGGCCTTGAAGTCTCCACTTATG
EST: GTGGATGGGAGCTTTGTGTTTAATAAAGGAAAG GTTCATAAGGTGCCCGCAAATGACATGGAGGCCTTGAAGTCTCCACTTATGEST: gi|8826330|gb|BE210060.1|BE210060
genomic: GTGGATGGGAGCTTTGTGTTTAATAAAGGAAAGgtatgtttgt ... gttggtgcagGTTCATAAGGTGCCCGCAAATGACATGGAGGCCTTGAAGTCTCCACTTATG
EST: ATCTCTCTTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTTTGTGTTTAATAAAGGAAAG GTTCATAAGGTGCCCGCACATGACATGGAGGCCTTGAAGTCTCCACTTATGEST: gi|151408340|gb|EV278148.1|EV278148
genomic: ATCTCTCTTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTTTGTGTTTAATAAAGGAAAGgtatgtttgt ... gttggtgcagGTTCATAAGGTGCCCGCAAATGACATGGAGGCCTTGAAGTCTCCACTTATG
EST: ATCTCTCTTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTTTGTGTTTAATAAAGGAAAG GTTCATAAGGTGCCCGCAAATGACATGGAGGCCCTTGAAGTCTCCACTTATEST: gi|24136625|gb|BU927135.1|BU927135
genomic: ATCTCTCTTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTTTGTGTTTAATAAAGGAAAGgtatgtttgt ... gttggtgcagGTTCATAAGGTGCCCGCAAATGACATGGAGGCC-TTGAAGTCTCCACTTAT
EST: ATCTCTCTTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTTTGTGTTTAATAAAGGAAAG GTTCATAAGGTGCCCGCAAATGACATGGAGGCCTTGAAGTCTCCACTTATG
genomic: ATCTCTCTTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTTTGTGTTTAATAAAGGAAAGgtatgtttgt ... gttggtgcagGTTCATAAGGTGCCCGCAAATGACATGGAGGCCTTGAAGTCTCCACTTATG
tttggtttagatgttagatgtcttaattaattgttttgcttgtgggttggtgcagGTTCATAAGGTGCCCGCAAATGACATGGAGGCCTTGAAGTCTCCACTTATGGGGCTATTTGAAAAACGCCGAGCACGCAAGTTTTTCATTTATGTGCAAA
aattaat putative branch site (score: 3)
tcttaattaattgttt TA-rich tract