Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtatgtttatatcatctgaagattattattattaataaaagcaacaaagggtagccatattgatattgattatgctctgtggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTAGAGATATGATGGAAAAATACTACATTGGTGAGATTGATGCATCAACCGT

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA06G13840.2
intron # 3
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA06G13840.2 (Glycine max), 3'ss of exon 3
lower sequence: AT5G53560.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 3
gtatgtttatatcatctgaagattattattattaataaaagcaacaaag------ggtagccatattgatattgattatgctctgtggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTAGAGATATGATGGAAAAATACTACATTGGTGAGATTGATGCATCAACCGT
       ||||  |  ||    |   | | ||| |     |     |||      |||  |  | |   |  ||||  || | | | | |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||  |||| || || |||||||| ||||| | |||||||||||||||| | || |  ||
------gtataaaacttgtgtttctctctgattcaaggcggatttgaagcggctcggtgactgtttctgttctgat-gtggtgttttgtttgcagGGAAAGATGCTACAAATGATTTTGAAGACGTTGGTCACAGCGACACTGCAAGGGACATGATGGACAAATATTTCATTGGTGAGATTGATTCGTCTAGTGT

upper sequence: GLYMA06G13840.2 (Glycine max), 3'ss of exon 3
lower sequence: Vv16s0098g01230.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 3
gtatgtt----tatatcatctgaagattat---------tattattaataaaagcaacaaagggtagccatattgatattgattatgctctgtggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTAGAGATATGATGGAAAAATACTACATTGGTGAGATTGATGCATCAACCGT
||| |||    ||||||| ||  ||   ||         | || |  |  ||| | |  | | |   | | |   | | ||| |    | | |    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||
gtaagttatcatatatcacctctagccaatctcacaccctgttgtctaccaaaccgatta-gtgcccctacacacaaagtgactgaattttct--tctgcagGGAAGGATGCGACAAATGATTTTGAAGATGTAGGCCACAGTGATGCAGCCAGAGACATGATGGAAAAATACTACATTGGTGAGATCGATCCCTCAAGCGT
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|298166973|gb|HO010412.1|HO010412
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|15812345|gb|BI784620.1|BI784620
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298179275|gb|HO027746.1|HO027746
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298188314|gb|HO035007.1|HO035007
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|31470547|gb|CD412575.1|CD412575
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTNATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|193358109|gb|FK322719.1|FK322719
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|58021022|gb|CX707764.1|CX707764
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|151395904|gb|EV265781.1|EV265781
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|254338919|gb|GR847636.1|GR847636
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|209697876|gb|BW670106.1|BW670106
EST:     TTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|151411570|gb|EV281381.1|EV281381
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|31305828|gb|CD391031.1|CD391031
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|13480888|gb|BG510231.1|BG510231
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|209704769|gb|BW661635.1|BW661635
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|193428714|gb|FK392234.1|FK392234
EST:     GGAGGTGATTGTAGGTTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: GGAGGTGA-TG-AGG-TTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|192298890|gb|FG987635.1|FG987635
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298178413|gb|HO024148.1|HO024148
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298175835|gb|HO015240.1|HO015240
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|33388056|gb|CA851263.1|CA851263
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|209704770|gb|BW661636.1|BW661636
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|151411605|gb|EV281416.1|EV281416
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|31467931|gb|CD409959.1|CD409959
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298167020|gb|HO010459.1|HO010459
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|23056491|gb|BU577734.1|BU577734
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|17401062|gb|BM177844.1|BM177844
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|209698677|gb|BW652478.1|BW652478
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298164775|gb|HO014420.1|HO014420
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|151403332|gb|EV273142.1|EV273142
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298172528|gb|HO019568.1|HO019568
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|31455889|gb|CD397917.1|CD397917
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|193343745|gb|FK313157.1|FK313157
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298177324|gb|HO027105.1|HO027105
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|151412458|gb|EV282270.1|EV282270
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298179218|gb|HO027689.1|HO027689
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|192298207|gb|FG991697.1|FG991697
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTCGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|254325211|gb|GR838092.1|GR838092
EST:     TTCATGGAGGATCATCCCGGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTCATGGAGGATCATCCC-GGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298171175|gb|HO016207.1|HO016207
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298183194|gb|HO028179.1|HO028179
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|11274941|gb|BF325266.1|BF325266
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|192297264|gb|FG990612.1|FG990612
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|208302414|gb|GE100445.1|GE100445
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|192330130|gb|FK020490.1|FK020490
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298188097|gb|HO032054.1|HO032054
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|213601456|gb|DB968744.1|DB968744
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|192322325|gb|FK014566.1|FK014566
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298177693|gb|HO023712.1|HO023712
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|17519508|gb|BM188550.1|BM188550
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298169879|gb|HO018503.1|HO018503
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|31463052|gb|CD405080.1|CD405080
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298188108|gb|HO032065.1|HO032065
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|4287721|gb|AI441230.1|AI441230
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|58017760|gb|CX704502.1|CX704502
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|193392359|gb|FK360492.1|FK360492
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|8827547|gb|BE211277.1|BE211277
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298169219|gb|HO020579.1|HO020579
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|58021922|gb|CX708663.1|CX708663
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|23726695|gb|BU761349.1|BU761349
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|192315197|gb|FK010021.1|FK010021
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|192322999|gb|FK016730.1|FK016730
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|13563430|gb|BG551659.1|BG551659
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|21887400|gb|BQ740613.1|BQ740613
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|24135391|gb|BU925901.1|BU925901
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|193437810|gb|FK403103.1|FK403103
EST:     GGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: GGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|151406627|gb|EV276442.1|EV276442
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298179784|gb|HO024999.1|HO024999
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|21993844|gb|BQ785372.1|BQ785372
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|193538166|gb|FK498099.1|FK498099
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|7692200|gb|AW760313.1|AW760313
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|9565458|gb|BE474967.1|BE474967
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|193427328|gb|FK394824.1|FK394824
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|192334282|gb|FK025515.1|FK025515
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298193832|gb|HO040480.1|HO040480
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|6665808|gb|AW277267.1|AW277267
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|213591669|gb|DB969769.1|DB969769
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|254325210|gb|GR838091.1|GR838091
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298193379|gb|HO033813.1|HO033813
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAGGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|192327580|gb|FK021285.1|FK021285
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|209697875|gb|BW670105.1|BW670105
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298192773|gb|HO033207.1|HO033207
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|18733709|gb|BM527767.1|BM527767
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298195212|gb|HO043740.1|HO043740
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|12689425|gb|BG155822.1|BG155822
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|192334283|gb|FK025516.1|FK025516
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|31561137|gb|CD486975.1|CD486975
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTNGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|21887230|gb|BQ740443.1|BQ740443
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298179008|gb|HO024743.1|HO024743
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|207799225|gb|GD768224.1|GD768224
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACNG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|18692776|gb|BM521624.1|BM521624
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|193729028|gb|FK663876.1|FK663876
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGGGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|12774789|gb|BG239737.1|BG239737
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|151396003|gb|EV265880.1|EV265880
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTACAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298185919|gb|HO031080.1|HO031080
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|8826450|gb|BE210180.1|BE210180
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|31306593|gb|CD391796.1|CD391796
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCTACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298183589|gb|HO028802.1|HO028802
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|151400920|gb|EV270734.1|EV270734
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|21601313|gb|BQ611644.1|BQ611644
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298167673|gb|HO012936.1|HO012936
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCGATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298168315|gb|HO014490.1|HO014490
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298198562|gb|HO040101.1|HO040101
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|193420868|gb|FK385821.1|FK385821
EST:     GGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: GGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|193364250|gb|FK331778.1|FK331778
EST:     GGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: GGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|11273705|gb|BF324081.1|BF324081
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|7028805|gb|AW458588.1|AW458588
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|31308233|gb|CD393436.1|CD393436
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|58023907|gb|CX710648.1|CX710648
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298184032|gb|HO029245.1|HO029245
EST:     TTTCAGGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|19345849|gb|BM890729.1|BM890729
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|6667006|gb|AW278465.1|AW278465
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|254322284|gb|GR837698.1|GR837698
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|151411522|gb|EV281333.1|EV281333
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298186870|gb|HO033969.1|HO033969
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|38192187|gb|CF921393.1|CF921393
EST:     ATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: ATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|8284787|gb|BE022346.1|BE022346
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|193355157|gb|FK321296.1|FK321296
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
EST: gi|298170122|gb|HO018746.1|HO018746
EST:     TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAG                         GGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA
genomic: TTTCATGGAGGATCATCCCGGAGGTGATGAGGTTTTGTTATCTGCAACAGgtatgtttat ... tggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTA


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ataaaagcaacaaagggtagccatattgatattgattatgctctgtggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTAGAGATATGATGGAAAAATACTACATTGGTGAGATTGATGCATCAACCGT
                      atattgatattgatta  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gtatgtttatatcatctgaagattattattattaataaaagcaacaaagggtagccatattgatattgattatgctctgtggattgcagGGAAAGATGCAACCAATGACTTTGAAGATGTGGGGCACAGTGATTCTGCTAGAGATATGATGGAAAAATACTACATTGGTGAGATTGATGCATCAACCGT

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GATGGA