1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
gtaagtagtgattctctgcttatcctattctttgtattgtgtttttcgtggtccaagatatgatttccgtgaatcgtgttgttgatgtgttgctaatggttttgcagGAGACAATGTCCAATGAACATGCCATGCGTTTTCCCTTTGTTGGGAGTGCAATGTTATTGTCACTTTTCTTACTCTTCAAGTTTTTATCTAAGGACTTGG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA06G08620.3 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCACTGTGTTTGTGGGCTGTTACCGCTCCGTTAAACCAACCCCACCAACT GAGACAATGTCCAATGAACATGCCATGCGTTTTCCCTTTGTTGGGAGTGCAEST: gi|6072670|gb|AW102057.1|AW102057
genomic: TCACTGTGTTTGTGGGATGTTACCGCTCCGTTAAACCAACCCCACCAACTgtaagtagtg ... ggttttgcagGAGACAATGTCCAATGAACATGCCATGCGTTTTCCCTTTGTTGGGAGTGCA
EST: TCACTGTGTTTGTGGGATGTTACCGCTCCGTTAAACCAACCCCACCAACT GAGACAATGTCCAATGAACATGCCATGCGTTTTCCCTTTGTTGGGAGTGCAEST: gi|213600256|gb|DB964336.1|DB964336
genomic: TCACTGTGTTTGTGGGATGTTACCGCTCCGTTAAACCAACCCCACCAACTgtaagtagtg ... ggttttgcagGAGACAATGTCCAATGAACATGCCATGCGTTTTCCCTTTGTTGGGAGTGCA
EST: TCACTGTGTTTGTGGGATGTTACCGCTCCGTTAAACCAACCCCACCAACT GAGACAATGTCCAATGAACATGCCATGCGTTTTCCCTTTGTTGGGAGTGCA
genomic: TCACTGTGTTTGTGGGATGTTACCGCTCCGTTAAACCAACCCCACCAACTgtaagtagtg ... ggttttgcagGAGACAATGTCCAATGAACATGCCATGCGTTTTCCCTTTGTTGGGAGTGCA
ccaagatatgatttccgtgaatcgtgttgttgatgtgttgctaatggttttgcagGAGACAATGTCCAATGAACATGCCATGCGTTTTCCCTTTGTTGGGAGTGCAATGTTATTGTCACTTTTCTTACTCTTCAAGTTTTTATCTAAGGACTTGG
tgctaat putative branch site (score: 2)
atatgattt TA-rich tract