1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtgattcttttatcattaattagctcttccatgtgttccattttcattgattgctaaaaaatgttgtggttttgcagATGTGGATTTCTAAAGGTGAATATGATGAGTCTGGCCCATCCATTGTCCACAGGAAGTGCTTCTAACTTCTAAGTACAAAATATGCTTCAATGGTGAAAT
species | Glycine max |
transcript | GLYMA05G32220.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTGTCTGGATTGGAGGATCAATCCTTGCATCCCTCAGCACCTTCCAGCAG ATGTGGATTTCTAAAGGTGAATATGATGAGTCTGGCCCATCCATTGTCCACEST: gi|298188723|gb|HO035416.1|HO035416
genomic: GTGTCTGGATTGGAGGATCAATCCTTGCATCCCTCAGCACCTTCCAACAGgtgattcttt ... ggttttgcagATGTGGATTTCTAAAGGTGAATATGATGAGTCTGGCCCATCCATTGTCCAC
EST: GTGTCTGGATTGGAGGATCAATCCTTGCATCCCTCAGCACCTTCCAACAG ATGTGGATTTCTAAAGGTGAATATGATGAGTCTGGCCCATCCATTGTCCACEST: gi|16996973|gb|BM086345.1|BM086345
genomic: GTGTCTGGATTGGAGGATCAATCCTTGCATCCCTCAGCACCTTCCAACAGgtgattcttt ... ggttttgcagATGTGGATTTCTAAAGGTGAATATGATGAGTCTGGCCCATCCATTGTCCAC
EST: GTGTCTGGATTGGAGGATCAATCCTTGCATCCCTCAGCACCTTCCAGCAG ATGTGGATTTCTAAAGGTGAATATGATGAGTCTGGCCCATCCATTGTCCACEST: gi|16347204|gb|BI972799.1|BI972799
genomic: GTGTCTGGATTGGAGGATCAATCCTTGCATCCCTCAGCACCTTCCAACAGgtgattcttt ... ggttttgcagATGTGGATTTCTAAAGGTGAATATGATGAGTCTGGCCCATCCATTGTCCAC
EST: GTGTCTGGATTGGAGGATCAATCCTTGCATCCCTCAGCACCTTCCAACAG ATGTGGATTTCTAAAGGTGAATATGATGAGTCTGGCCCATCCATTGTCCACEST: gi|13790240|gb|BG652831.1|BG652831
genomic: GTGTCTGGATTGGAGGATCAATCCTTGCATCCCTCAGCACCTTCCAACAGgtgattcttt ... ggttttgcagATGTGGATTTCTAAAGGTGAATATGATGAGTCTGGCCCATCCATTGTCCAC
EST: GTGTCTGGATTGGAGGATCAATCCTTGCATCCCTCAGCACCTTCCAGCAG ATGTGGATTTCTAAAGGTGAATATGATGAGTCTGGCCCATCCATTGTCCAC
genomic: GTGTCTGGATTGGAGGATCAATCCTTGCATCCCTCAGCACCTTCCAACAGgtgattcttt ... ggttttgcagATGTGGATTTCTAAAGGTGAATATGATGAGTCTGGCCCATCCATTGTCCAC
gctcttccatgtgttccattttcattgattgctaaaaaatgttgtggttttgcagATGTGGATTTCTAAAGGTGAATATGATGAGTCTGGCCCATCCATTGTCCACAGGAAGTGCTTCTAACTTCTAAGTACAAAATATGCTTCAATGGTGAAAT
tgctaaa putative branch site (score: 2)
taaaaaatgtt TA-rich tract