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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaagttcacttcccatgacttacatgccaattatactgcaatgattttatttgcttggttatggtgttattttctgttgtgctgagagataggatgatgatttggtaatttgagtgacttggttatattgttatccttcatactttttttctaaatcctatttttaatactaattttttgtctacactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA04G37120.2
intron # 3
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|208247860|gb|GE045332.1|GE045332
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|298177656|gb|HO023675.1|HO023675
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGTTTCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|192309529|gb|FK000191.1|FK000191
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGCTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|207842015|gb|GD816335.1|GD816335
EST:     GGAAATGTTTCCAGGAGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|193378826|gb|FK345167.1|FK345167
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|151401263|gb|EV271077.1|EV271077
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|9258998|gb|BE347145.1|BE347145
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|17963409|gb|BM270158.1|BM270158
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|208205787|gb|GE007052.1|GE007052
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|18692713|gb|BM521561.1|BM521561
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|208302968|gb|GE099585.1|GE099585
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|192329979|gb|FK021565.1|FK021565
EST:     AAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: AAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|213620429|gb|DB957326.1|DB957326
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|151396767|gb|EV266640.1|EV266640
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGAGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|19347879|gb|BM892503.1|BM892503
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|31561132|gb|CD486970.1|CD486970
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|298187616|gb|HO034765.1|HO034765
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|7795303|gb|AW780700.1|AW780700
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGATGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|207810549|gb|GD781658.1|GD781658
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|192329978|gb|FK021564.1|FK021564
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|15813356|gb|BI785631.1|BI785631
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|254314708|gb|GR829701.1|GR829701
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|4396798|gb|AI495795.1|AI495795
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TG-TGTTTCTG
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTG
EST: gi|192300142|gb|FG989264.1|FG989264
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|208272061|gb|GE069207.1|GE069207
EST:     TTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: TTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|298169520|gb|HO020880.1|HO020880
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|19348668|gb|BM893200.1|BM893200
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|192295190|gb|FG986909.1|FG986909
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|26058029|gb|CA800943.1|CA800943
EST:     TTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: TTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|298185314|gb|HO030527.1|HO030527
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|208212225|gb|GE015330.1|GE015330
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGCGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|42722502|gb|CK768401.1|CK768401
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|15287608|gb|BI471499.1|BI471499
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|7685411|gb|AW756059.1|AW756059
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|208063571|gb|GD861501.1|GD861501
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|254318262|gb|GR832430.1|GR832430
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|298165799|gb|HO008770.1|HO008770
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|9564337|gb|BE473846.1|BE473846
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|151409150|gb|EV278958.1|EV278958
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|18038851|gb|BM307145.1|BM307145
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|11690340|gb|BF598016.1|BF598016
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|298186801|gb|HO037434.1|HO037434
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|31463360|gb|CD405388.1|CD405388
EST:     AGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCTTGGTTGC
genomic: AGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
EST: gi|151402916|gb|EV272729.1|EV272729
EST:     GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTC                         TGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC
genomic: GGAAATGTTTCCAGGTGGTACAAGCACATTGATGCTTTGTTGAGAATCTCgtaagttcac ... cactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGC


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

atactttttttctaaatcctatttttaatactaattttttgtctacactctacagTGGTGTTTCTGGCGAGGGATCTGGTGTTATTGTTGAGGGATCCCTGGTTGCGGAGCCTGTTGCAACTCCCCCAGCTGCTGACACTAAG
                            tactaat  putative branch site (score: 1)
     ttttttctaaatccta  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
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