1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtatatatgaaccacagcatcaaaaccctaatctaatcctccccctccataaacaaagtcagtgttgttttatgtgcagAAATGGTGTAAAGCTTGTGTTCTGCTTGATGGACTGAATAGAGGTTTGCCTAAACTGGGGATTGGACGAAGTCGTGGCAGTGTTGCTTCTGATAATGGAA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA04G00350.3 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GATGCCAGAGCAGGGAACATAGCGAACGCTGCGGTTATATTTCTAGTCAG AAATGGTGTAAAGCTTGTGTTCTGCTTGATGGACTGAATAGAGGTTTGCCTEST: gi|193556231|gb|FK511454.1|FK511454
genomic: GATGCCAGAGCAGGGAACAT-GCGAACGCTGCGGTTATATTTCTAGTCAGgtatatatga ... ttatgtgcagAAATGGTGTAAAGCTTGTGTTCTGCTTGATGGACTGAATAGAGGTTTGCCT
EST: AGATGCCAGAGCAGGGAACATGCGAACGCTGCGGTTATATTTCTAGTCAG AAATGGTGTAAAGCTTGTGTTCTGCTTGATGGACTGAATAGAGGTTTGCCT
genomic: AGATGCCAGAGCAGGGAACATGCGAACGCTGCGGTTATATTTCTAGTCAGgtatatatga ... ttatgtgcagAAATGGTGTAAAGCTTGTGTTCTGCTTGATGGACTGAATAGAGGTTTGCCT
accctaatctaatcctccccctccataaacaaagtcagtgttgttttatgtgcagAAATGGTGTAAAGCTTGTGTTCTGCTTGATGGACTGAATAGAGGTTTGCCTAAACTGGGGATTGGACGAAGTCGTGGCAGTGTTGCTTCTGATAATGGAA
atctaat putative branch site (score: 3)
ttgtttt putative PPT
ataaacaaa TA-rich tract