1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
...ctgatatcactgctattgttctttgacttgtttgaacaaattttgttagcttttgatttcttgttaattttattttctcattggatctctaattaatcagGGTCCTCGTGGTTCCCGGGACCGGGAATATATGGGTCGGGGTCCACCTCCTGGATCTGGGCGATGCTTTAACTGTGGCATTGATGGTCATTGGGCCCGAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA03G33270.3 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TATTATTGTGGAATTTGCCAAGGGG GGTCCTCGTGGTTCCCGGGACCGGGAATATATGGGTCGGGGTCCACCTCCTEST: gi|193684971|gb|FK626495.1|FK626495
genomic: TATTATTGTGGAATTTGCCAAGGGGgtaggaatta ... aattaatcagGGTCCTCGTGGTTCCCGGGACCGGGAATATATGGGTCGGGGTCCACCTCCT
EST: TATTATTGTGGAATTTGCCAAGGGG GGTCCTCGTGGTTCCCGGGACCGGGAATATATGGGTCGGGGTCCACCTCCTEST: gi|254344581|gb|GR855452.1|GR855452
genomic: TATTATTGTGGAATTTGCCAAGGGGgtaggaatta ... aattaatcagGGTCCTCGTGGTTCCCGGGACCGGGAATATATGGGTCGGGGTCCACCTCCT
EST: ATGGTCGTGATGTTGAAGGAAGTCGTATTATTGTGGAATTTGCCAAGGGG GGTCCTCGTGGTTCCCGGGACCGGGAATATATGGGTCGGGGTCCACCTCCTEST: gi|19347351|gb|BM892231.1|BM892231
genomic: ATGGTCGTGATGTTGAAGGAAGTCGTATTATTGTGGAATTTGCCAAGGGGgtaggaatta ... aattaatcagGGTCCTCGTGGTTCCCGGGACCGGGAATATATGGGTCGGGGTCCACCTCCT
EST: ATGGTCGTGATGTTGAAGGAAGTCGTATTATTGTGGAATTTGCCAAGGGG GGTCCTCGTGGTTCCCGGGACCGGGAATATATGGGTCGGGGTCCACCTCCT
genomic: ATGGTCGTGATGTTGAAGGAAGTCGTATTATTGTGGAATTTGCCAAGGGGgtaggaatta ... aattaatcagGGTCCTCGTGGTTCCCGGGACCGGGAATATATGGGTCGGGGTCCACCTCCT
ttagcttttgatttcttgttaattttattttctcattggatctctaattaatcagGGTCCTCGTGGTTCCCGGGACCGGGAATATATGGGTCGGGGTCCACCTCCTGGATCTGGGCGATGCTTTAACTGTGGCATTGATGGTCATTGGGCCCGAG
ctctaat putative branch site (score: 3)
ttttgatttcttgtta TA-rich tract