1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
...cattgcatttggaaattgtgattgtagaaaacttgtataaagcttccatatatcatgtgattgactttataaacttcatttatttgccttctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGAGGGTTATGCACTCCCACATGCCATCCTTCGTCTTGATCTGGCCGGTCG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA02G10170.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|5607071|gb|AI901169.1|AI901169
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|19347448|gb|BM892328.1|BM892328
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATEST: gi|209721507|gb|BW671687.1|BW671687
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGAT
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|10846439|gb|BF069336.1|BF069336
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|21256346|gb|BQ453234.1|BQ453234
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTTGTATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATEST: gi|209700254|gb|BW664479.1|BW664479
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTG-TTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTAT
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|19453444|gb|BM954854.1|BM954854
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|8282814|gb|BE020375.1|BE020375
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|9204275|gb|BE330499.1|BE330499
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|26058538|gb|CA801452.1|CA801452
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|10843200|gb|BF066513.1|BF066513
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|209717612|gb|BW679692.1|BW679692
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|7924975|gb|AW831001.1|AW831001
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGAGTTGGATTCTGGTGATAGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|15200083|gb|BI424163.1|BI424163
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|17021518|gb|BM092552.1|BM092552
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|192326949|gb|FK019226.1|FK019226
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|213599164|gb|DB962243.1|DB962243
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|213599862|gb|DB973906.1|DB973906
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|4292315|gb|AI441887.1|AI441887
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|24136171|gb|BU926681.1|BU926681
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|7692085|gb|AW760200.1|AW760200
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|213594404|gb|DB967988.1|DB967988
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|17023480|gb|BM094514.1|BM094514
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATEST: gi|7926085|gb|AW832111.1|AW832111
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGAT
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|15201108|gb|BI424697.1|BI424697
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|151400375|gb|EV270189.1|EV270189
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|213613943|gb|DB960936.1|DB960936
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|213589283|gb|DB967762.1|DB967762
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|209701316|gb|BW655911.1|BW655911
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|10237529|gb|BE806417.1|BE806417
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|209698678|gb|BW652479.1|BW652479
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|15812971|gb|BI785246.1|BI785246
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACEST: gi|213600758|gb|DB968806.1|DB968806
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCAC
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|7924321|gb|AW830347.1|AW830347
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|27426342|gb|CA937862.1|CA937862
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGGAT-CTGGTGATGGGGTCAGCCACACTGTCCCTEST: gi|6481946|gb|AW201217.1|AW201217
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGG-ATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCT
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|209701528|gb|BW667349.1|BW667349
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|15813154|gb|BI785429.1|BI785429
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|213587909|gb|DB971398.1|DB971398
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|13125497|gb|BG316067.1|BG316067
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: GCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|6483040|gb|AW202238.1|AW202238
genomic: GCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTEST: gi|42722420|gb|CK768322.1|CK768322
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCT
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|15286966|gb|BI470857.1|BI470857
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGGCGTACAACTG GGATTGTGTTGGATTCTGGCGATGGGGGCAGC-ACACTGTTCCCTATCTAEST: gi|298172407|gb|HO019447.1|HO019447
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGT-CCCTATCTA
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|21677905|gb|BQ630256.1|BQ630256
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGEST: gi|12489563|gb|BG043084.1|BG043084
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
EST: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTG GTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
genomic: CGTAGCCATCCAAGCTGTTCTTTCACTGTATGCAAGTGGTCGTACAACTGgtaagcaatt ... ctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATG
ccatatatcatgtgattgactttataaacttcatttatttgccttctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGAGGGTTATGCACTCCCACATGCCATCCTTCGTCTTGATCTGGCCGGTCG
gattgac putative branch site (score: 3)
cttcatttatttgcct putative PPT
actttataaacttcat TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| cattgcatttggaaattgtgattgtagaaaacttgtataaagcttccatatatcatgtgattgactttataaacttcatttatttgccttctttttgcagGTATTGTGTTGGATTCTGGTGATGGTGTCAGCCACACTGTCCCTATCTATGAGGGTTATGCACTCCCACATGCCATCCTTCGTCTTGATCTGGCCGGTCG
- -tgcattt
- - - - - - - - -gtgattg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gcttcca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tcatgtg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ttgcctt